19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2463 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2463  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  579  1e-164  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1009  hypothetical protein  25.66 
 
 		 268 aa  85.1  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.9022  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0110  hypothetical protein  27.42 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2333  hypothetical protein  27.76 
 
 		 248 aa  81.6  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.83902  normal  0.0456221 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1137  hypothetical protein  23.66 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2824  hypothetical protein  28.4 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.266593  normal  0.549163 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003214  hypothetical protein  24.53 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2017  hypothetical protein  22.59 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.02732 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1267  hypothetical protein  28.47 
 
 		 314 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.161227  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3453  hypothetical protein  26.95 
 
 		 201 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000598107 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0834  hypothetical protein  23.3 
 
 		 285 aa  51.2  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.430945  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3372  hypothetical protein  20.36 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000516868  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3073  hypothetical protein  23.7 
 
 		 317 aa  50.4  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00754966  normal  0.187539 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3092  hypothetical protein  23.11 
 
 		 327 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0671973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2747  hypothetical protein  21.6 
 
 		 275 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3901  hypothetical protein  21.01 
 
 		 389 aa  42.4  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.257798  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1726  hypothetical protein  21.62 
 
 		 305 aa  42.4  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00978889 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4416  hypothetical protein  21.62 
 
 		 305 aa  42.4  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2456  hypothetical protein  23.74 
 
 		 199 aa  42  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110138  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>