More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1098 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1098  Superoxide dismutase  100 
 
 		 200 aa  417  1e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00115059  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1539  Superoxide dismutase  78.5 
 
 		 200 aa  340  5.999999999999999e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.172544  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1224  superoxide dismutase  78 
 
 		 200 aa  340  1e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0983  superoxide dismutase  77 
 
 		 200 aa  332  2e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.474017  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1195  Superoxide dismutase  76.38 
 
 		 201 aa  331  4e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.174298 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0967  superoxide dismutase  75.51 
 
 		 198 aa  327  5.0000000000000004e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.324729  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4520  Superoxide dismutase  69.35 
 
 		 199 aa  295  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.111456 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1462  Superoxide dismutase  70 
 
 		 201 aa  293  1e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0424  Superoxide dismutase  65.33 
 
 		 200 aa  283  9e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0435  Superoxide dismutase  65.33 
 
 		 200 aa  283  9e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0801  superoxide dismutase  67.02 
 
 		 229 aa  276  1e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.818705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1660  Superoxide dismutase  62.76 
 
 		 199 aa  263  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0501  superoxide dismutase  62.18 
 
 		 205 aa  261  6e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.342274  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1895  superoxide dismutase  59.7 
 
 		 201 aa  258  4e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.514974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1767  superoxide dismutase  61.03 
 
 		 197 aa  256  1e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.545768 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1760  superoxide dismutase  57.79 
 
 		 227 aa  254  5e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3417  manganese and iron superoxide dismutase  59.79 
 
 		 241 aa  254  6e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0123938 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0378  Superoxide dismutase  57.07 
 
 		 198 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000638563  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2066  Superoxide dismutase  60.85 
 
 		 236 aa  251  4.0000000000000004e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1163  Superoxide dismutase  60 
 
 		 207 aa  251  4.0000000000000004e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2067  superoxide dismutase, Fe  58.95 
 
 		 210 aa  248  4e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.854961  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0309  superoxide dismutase  57.44 
 
 		 209 aa  248  5e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000500167  normal  0.123297 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1938  superoxide dismutase  56.92 
 
 		 209 aa  244  9e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.268541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0963  manganese and iron superoxide dismutase  57.5 
 
 		 200 aa  241  3.9999999999999997e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2231  superoxide dismutase  56.41 
 
 		 209 aa  241  5e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.138475 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4281  superoxide dismutase  56.12 
 
 		 199 aa  240  1e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1986  Superoxide dismutase  58.33 
 
 		 238 aa  236  2e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0738  superoxide dismutase, Fe  53.69 
 
 		 206 aa  235  3e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2458  superoxide dismutase, Fe  57.87 
 
 		 194 aa  234  6e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.688146  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3322  superoxide dismutase  56.85 
 
 		 193 aa  231  5e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0187  superoxide dismutase  52.28 
 
 		 204 aa  231  5e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457319 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1756  superoxide dismutase  56.28 
 
 		 192 aa  231  6e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000049091  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2897  superoxide dismutase, iron  54.55 
 
 		 192 aa  230  8.000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3039  superoxide dismutase, iron  54.55 
 
 		 192 aa  230  9e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4937  superoxide dismutase  55.84 
 
 		 193 aa  229  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1863  superoxide dismutase  55.78 
 
 		 192 aa  230  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.410173  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0744  superoxide dismutase  54.31 
 
 		 221 aa  229  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0540  superoxide dismutase  54.82 
 
 		 192 aa  229  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.950904 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2271  superoxide dismutase  54.31 
 
 		 221 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00171574  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56780  superoxide dismutase  55.33 
 
 		 193 aa  228  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0933  superoxide dismutase (Fe)  54.31 
 
 		 192 aa  228  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200244  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0930  superoxide dismutase (Fe)  54.31 
 
 		 192 aa  228  6e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132223  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1085  superoxide dismutase  53.81 
 
 		 221 aa  228  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00846047  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1043  superoxide dismutase  54.31 
 
 		 192 aa  228  6e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00491913  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2148  superoxide dismutase  54.31 
 
 		 192 aa  228  6e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0566  superoxide dismutase  54.31 
 
 		 192 aa  228  6e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0641217  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0822  superoxide dismutase  55.21 
 
 		 238 aa  227  8e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.600443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1912  superoxide dismutase  54.08 
 
 		 193 aa  226  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.137482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4486  superoxide dismutase  54.55 
 
 		 198 aa  227  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0534582 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2571  superoxide dismutase  55.28 
 
 		 192 aa  227  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.489375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0753  superoxide dismutase  54.82 
 
 		 192 aa  226  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174612  normal  0.215519 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6857  Superoxide dismutase  53.85 
 
 		 197 aa  226  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0552512 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1601  superoxide dismutase  54.08 
 
 		 193 aa  226  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3219  Superoxide dismutase  52.28 
 
 		 194 aa  226  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0981  superoxide dismutase  54.04 
 
 		 198 aa  225  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581007  hitchhiker  0.000228043 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0915  superoxide dismutase  54.04 
 
 		 198 aa  225  4e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0298  superoxide dismutase  53.27 
 
 		 193 aa  225  4e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.775999  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1895  superoxide dismutase (Fe)  53.27 
 
 		 193 aa  225  4e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0954  superoxide dismutase  54.04 
 
 		 198 aa  225  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.80559 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01626  superoxide dismutase, Fe  54.59 
 
 		 193 aa  224  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4473  superoxide dismutase  54.04 
 
 		 198 aa  224  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125166 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1984  Superoxide dismutase  54.59 
 
 		 193 aa  224  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.621128  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1973  superoxide dismutase  54.59 
 
 		 193 aa  224  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0009948 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1853  superoxide dismutase  54.59 
 
 		 193 aa  224  5.0000000000000005e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000511005  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1542  superoxide dismutase  54.59 
 
 		 193 aa  224  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.695463  normal  0.165364 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1735  superoxide dismutase  54.59 
 
 		 193 aa  224  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0141664  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2368  superoxide dismutase  54.59 
 
 		 193 aa  224  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0034219  normal  0.192505 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1869  superoxide dismutase  54.59 
 
 		 193 aa  224  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000439054  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01616  hypothetical protein  54.59 
 
 		 193 aa  224  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37820  Fe-Superoxide dismutase  54.77 
 
 		 193 aa  224  8e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41434  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1743  superoxide dismutase  53.57 
 
 		 193 aa  224  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000440254  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1527  superoxide dismutase  53.57 
 
 		 193 aa  224  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2803  Superoxide dismutase  54.31 
 
 		 233 aa  224  9e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.327122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1015  superoxide dismutase, Fe  51.78 
 
 		 194 aa  223  1e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.011206 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2428  superoxide dismutase  54.59 
 
 		 193 aa  223  1e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.785927  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2397  Superoxide dismutase  54.31 
 
 		 233 aa  223  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0885  SecE subunit of protein translocation complex  55.05 
 
 		 193 aa  223  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000205445  hitchhiker  0.00000630572 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0769  superoxide dismutase  53.81 
 
 		 192 aa  223  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2196  superoxide dismutase  53.77 
 
 		 192 aa  223  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.515732  hitchhiker  0.00000576689 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1782  superoxide dismutase  54.55 
 
 		 194 aa  222  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000439358  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1819  superoxide dismutase  54.55 
 
 		 194 aa  222  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000821956  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4363  superoxide dismutase, Fe  54.27 
 
 		 193 aa  223  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2503  Superoxide dismutase  54.55 
 
 		 194 aa  222  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000289489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1687  superoxide dismutase  55.05 
 
 		 194 aa  223  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000404322  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1775  superoxide dismutase  54.55 
 
 		 194 aa  222  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000480024  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1572  superoxide dismutase  55.05 
 
 		 194 aa  223  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000380978  normal  0.113962 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1647  superoxide dismutase  55.05 
 
 		 194 aa  223  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000641638  hitchhiker  0.000247019 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1639  manganese and iron superoxide dismutase  55.05 
 
 		 194 aa  223  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000920942  normal  0.988511 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2881  superoxide dismutase, Fe  55.05 
 
 		 194 aa  222  3e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1541  superoxide dismutase  53.06 
 
 		 193 aa  222  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000210127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0539  manganese and iron superoxide dismutase  52.79 
 
 		 192 aa  222  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00002429  hitchhiker  0.00000111544 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5874  superoxide dismutase  53.3 
 
 		 192 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0166877  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2463  Superoxide dismutase  52.28 
 
 		 193 aa  221  4.9999999999999996e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1963  superoxide dismutase  54 
 
 		 194 aa  221  6e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271229  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4059  superoxide dismutase  53.27 
 
 		 193 aa  221  8e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2461  superoxide dismutase  53.3 
 
 		 192 aa  220  9e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00028549 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2591  superoxide dismutase  53.3 
 
 		 192 aa  220  9e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3212  manganese and iron superoxide dismutase  50.76 
 
 		 194 aa  220  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000662131  normal  0.274821 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02750  iron superoxide dismutase  54.23 
 
 		 193 aa  220  9.999999999999999e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1385  superoxide dismutase  53.81 
 
 		 192 aa  219  1.9999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>