27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0726 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0726  major antigenic peptide PEB2  100 
 
 
247 aa  491  9.999999999999999e-139  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.1322  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0799  major antigenic peptide PEB2  71.72 
 
 
246 aa  349  2e-95  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.646416  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0869  major antigenic peptide PEB2  71.31 
 
 
246 aa  347  1e-94  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.572076  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2270  hypothetical protein  44.08 
 
 
254 aa  209  3e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.239971  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0399  extracellular solute-binding protein family 1  45.87 
 
 
255 aa  202  3e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3615  hypothetical protein  40.33 
 
 
253 aa  185  6e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.520257  hitchhiker  0.00533129 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2390  AcfC-like protein  40.08 
 
 
259 aa  168  7e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0415  hypothetical protein  37.66 
 
 
243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000733023  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1760  porcine attaching-effacing associated protein  33.6 
 
 
248 aa  133  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000702391  normal  0.0238437 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0315  major antigenic peptide PEB3  32.3 
 
 
250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0337  major antigenic peptide PEB3  32.3 
 
 
250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1380  major antigenic peptide PEB3  34.77 
 
 
249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6952  hypothetical protein  29.65 
 
 
247 aa  126  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.75245 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00556  accessory colonization factor  33.33 
 
 
265 aa  124  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4641  extracellular solute-binding protein  29.54 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0366  accessory colonization factor AcfC  30.08 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1395  ABC-type molybdate transport system periplasmic component-like protein  29.79 
 
 
171 aa  48.5  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1978  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.03 
 
 
323 aa  48.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.201567 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0723  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 
287 aa  46.6  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1821  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  22.35 
 
 
254 aa  46.2  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.233518  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1600  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.19 
 
 
263 aa  45.4  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0044  thiosulphate-binding protein  25.79 
 
 
385 aa  43.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195735  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2326  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate- binding protein  27.22 
 
 
334 aa  43.1  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000119117  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4018  thiosulphate-binding protein  23.33 
 
 
335 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.206129  normal  0.132982 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0866  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  25.77 
 
 
334 aa  42.7  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2226  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.03 
 
 
265 aa  42.4  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.78167e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1398  thiosulphate-binding protein  23.86 
 
 
336 aa  42  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>