23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0047 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0047  CHAP domain containing protein  100 
 
 
263 aa  528  1e-149  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.117415  normal  0.141274 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5979  CHAP domain-containing protein  48.33 
 
 
251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5951  CHAP domain-containing protein  50.26 
 
 
188 aa  162  7e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2357  Peptidase M23  43.37 
 
 
402 aa  65.9  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2144  hypothetical protein  43.06 
 
 
414 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00533951  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0779  LasA protease precursor  43.06 
 
 
424 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.113695  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0869  LasA protease precursor  43.06 
 
 
424 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1834  LasA protease precursor  43.06 
 
 
414 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.341416  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1033  surface antigen  37.89 
 
 
390 aa  55.5  0.0000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4284  CHAP domain-containing protein  35.87 
 
 
360 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.838801  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1705  surface antigen  32.14 
 
 
303 aa  51.6  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000827022  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4510  CHAP domain-containing protein  35.56 
 
 
359 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.160949  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4183  CHAP domain-containing protein  27.87 
 
 
358 aa  49.7  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0939  surface antigen  37.65 
 
 
449 aa  48.9  0.00008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.893795  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3502  CHAP domain-containing protein  35.53 
 
 
279 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4551  CHAP domain containing protein  30.41 
 
 
357 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.374294 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1198  hypothetical protein  38.36 
 
 
272 aa  48.5  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1683  immunogenic secreted protein, putative  33.78 
 
 
512 aa  48.1  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00328189  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0057  cell wall protein precursor, choline binding protein  38.46 
 
 
279 aa  47  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2263  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.43 
 
 
655 aa  46.6  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0398  CHAP domain protein  32.43 
 
 
381 aa  45.4  0.0009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6699  hypothetical protein  39.13 
 
 
415 aa  42.7  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1814  Lytic Transglycosylase  31.87 
 
 
482 aa  42.4  0.009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>