13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_13180 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_13180  SAF domain-containing protein  100 
 
 		 210 aa  412  1e-114  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20640  Flp pilus assembly protein CpaB  45.28 
 
 		 273 aa  160  1e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0535  Flp pilus assembly protein CpaB  40.93 
 
 		 215 aa  135  4e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1036  SAF domain protein  30.62 
 
 		 275 aa  95.5  5e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2114  SAF domain-containing protein  26.32 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3274  SAF domain protein  30.43 
 
 		 218 aa  52.4  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.785006  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2318  Flp pilus assembly protein CpaB  25.11 
 
 		 233 aa  52.4  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1021  Flp pilus assembly protein CpaB  28.3 
 
 		 258 aa  48.9  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1039  Flp pilus assembly protein CpaB  28.12 
 
 		 233 aa  46.6  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.268471  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2923  hypothetical protein  28.37 
 
 		 256 aa  45.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00621975  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2931  hypothetical protein  27.74 
 
 		 259 aa  44.3  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.59237  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1894  SAF domain-containing protein  39.06 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.832512  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0069  SAF domain-containing protein  28.49 
 
 		 317 aa  41.6  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723058 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>