16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_07340 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_07340  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  800    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.471719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2362  hypothetical protein  51.27 
 
 		 391 aa  315  9.999999999999999e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06750  hypothetical protein  50 
 
 		 369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00270  hypothetical protein  39.53 
 
 		 246 aa  72.8  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19600  hypothetical protein  30.99 
 
 		 411 aa  55.5  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.652812  hitchhiker  0.00117043 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0656  chromosome segregation ATPases-like protein  29.51 
 
 		 526 aa  52  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0611009  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2136  NLP/P60 protein  24.6 
 
 		 389 aa  50.8  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000118144  normal  0.895402 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1075  hypothetical protein  25.15 
 
 		 413 aa  50.1  0.00007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.855575 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  21.45 
 
 		 441 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0380  hypothetical protein  26.35 
 
 		 370 aa  48.9  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.468235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0555  rare lipoprotein A  36.36 
 
 		 159 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.789792  normal  0.255323 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67790  putative membrane-bound metallopeptidase  25.52 
 
 		 428 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498493  normal  0.610112 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0175  rare lipoprotein A  36 
 
 		 156 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  20.88 
 
 		 432 aa  43.1  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3167  peptidase M23B  25.77 
 
 		 366 aa  43.1  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0403  hypothetical protein  35.24 
 
 		 182 aa  42.7  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.746507  normal  0.06763 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>