32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2464 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2464  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 		 605 aa  1245    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2463  Pyrrolo-quinoline quinone  60.08 
 
 		 604 aa  684    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0739  hypothetical protein  44.37 
 
 		 574 aa  487  1e-136  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166259  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2086  Pyrrolo-quinoline quinone  37.88 
 
 		 568 aa  350  3e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2085  Pyrrolo-quinoline quinone  38.55 
 
 		 569 aa  341  2e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3457  Pyrrolo-quinoline quinone  38.7 
 
 		 585 aa  339  7e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000191045  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  23.22 
 
 		 687 aa  59.7  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  24.37 
 
 		 653 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  23.58 
 
 		 774 aa  54.3  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  23.66 
 
 		 652 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2197  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  25.71 
 
 		 385 aa  50.1  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.763782  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3733  Pyrrolo-quinoline quinone  27.78 
 
 		 562 aa  50.1  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1293  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.23 
 
 		 395 aa  47.8  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.664438  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4240  Pyrrolo-quinoline quinone  27.61 
 
 		 490 aa  47.8  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00516774  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  23.18 
 
 		 619 aa  46.6  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1397  serine/threonine protein kinase  26.47 
 
 		 643 aa  46.6  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323701  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0271  Pyrrolo-quinoline quinone  23.74 
 
 		 445 aa  47  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.943298 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2355  Pyrrolo-quinoline quinone  24.17 
 
 		 730 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0680369  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  21.3 
 
 		 484 aa  45.8  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1863  Pyrrolo-quinoline quinone  29.84 
 
 		 462 aa  46.2  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05630  FOG: WD40-like repeat  25.33 
 
 		 475 aa  46.2  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.687981  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1308  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.03 
 
 		 395 aa  45.1  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000307899  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0923  Pyrrolo-quinoline quinone  23.53 
 
 		 371 aa  45.1  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00190176  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2088  hypothetical protein  40.91 
 
 		 73 aa  44.7  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  24.17 
 
 		 475 aa  44.7  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3145  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.81 
 
 		 395 aa  43.9  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0657183 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2987  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.81 
 
 		 395 aa  43.9  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.198648  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2649  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.81 
 
 		 395 aa  43.9  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3002  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.81 
 
 		 395 aa  43.9  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0839555  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1376  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.81 
 
 		 395 aa  43.9  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.877608  normal  0.696352 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  19.37 
 
 		 423 aa  43.5  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3592  Pyrrolo-quinoline quinone  26.28 
 
 		 442 aa  43.5  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>