More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2208 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  100 
 
 
387 aa  803    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  75.13 
 
 
392 aa  628  1e-179  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  75.13 
 
 
392 aa  627  1e-179  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  70.98 
 
 
390 aa  600  1e-170  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  61.36 
 
 
407 aa  508  1e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  59.22 
 
 
386 aa  495  1e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  57.52 
 
 
399 aa  479  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1205  putative aspartate aminotransferase  55.06 
 
 
397 aa  467  9.999999999999999e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  55.26 
 
 
388 aa  463  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0048  aminotransferase class I and II  55.56 
 
 
401 aa  461  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00536151  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  55.09 
 
 
390 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2403  aminotransferase class I and II  53.48 
 
 
387 aa  456  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0215397  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1124  aspartate aminotransferase  53.93 
 
 
398 aa  456  1e-127  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  54.21 
 
 
391 aa  456  1e-127  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  55.12 
 
 
393 aa  451  1.0000000000000001e-126  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1342  aspartate aminotransferase  52.88 
 
 
398 aa  449  1e-125  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1153  aminotransferase  52.88 
 
 
398 aa  449  1e-125  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  50 
 
 
405 aa  447  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0041  aminotransferase class I and II  51.99 
 
 
402 aa  441  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  0.197817 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  51.83 
 
 
386 aa  438  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  52.11 
 
 
393 aa  436  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  50.39 
 
 
404 aa  435  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  53.61 
 
 
388 aa  437  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  54.47 
 
 
390 aa  433  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  52.27 
 
 
396 aa  428  1e-119  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  49.34 
 
 
385 aa  425  1e-118  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  50.66 
 
 
388 aa  424  1e-117  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  51.04 
 
 
396 aa  424  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  50.78 
 
 
396 aa  422  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  50.52 
 
 
396 aa  418  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  50.52 
 
 
396 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  50.78 
 
 
396 aa  421  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  50.26 
 
 
396 aa  418  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  50.26 
 
 
396 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  50.26 
 
 
396 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  50.26 
 
 
396 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  50 
 
 
396 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  50.26 
 
 
396 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  48.42 
 
 
400 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  49.22 
 
 
387 aa  411  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  50.52 
 
 
391 aa  413  1e-114  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0003  aminotransferase, class I and II  49.61 
 
 
386 aa  410  1e-113  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.987312  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1533  aminotransferase class I and II  50.13 
 
 
385 aa  410  1e-113  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  49.61 
 
 
386 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  50 
 
 
388 aa  405  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1745  aminotransferase class I and II  51.59 
 
 
393 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1304  aminotransferase class I and II  50.39 
 
 
410 aa  404  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  49.87 
 
 
387 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3529  aminotransferase class I and II  48.81 
 
 
385 aa  396  1e-109  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406883  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2839  aminotransferase class I and II  47.91 
 
 
395 aa  394  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326737 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2858  aminotransferase class I and II  48.27 
 
 
381 aa  391  1e-107  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.961149  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3535  aminotransferase class I and II  49.6 
 
 
381 aa  385  1e-106  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2149  aminotransferase class I and II  48.4 
 
 
383 aa  384  1e-105  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.152538 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1319  aminotransferase class I and II  48.55 
 
 
380 aa  373  1e-102  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0755058 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4133  aminotransferase A  45.31 
 
 
385 aa  364  1e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.562408  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  45.31 
 
 
387 aa  363  3e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4060  aminotransferase A  45.31 
 
 
387 aa  361  1e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3750  aminotransferase A  45.05 
 
 
387 aa  361  1e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1124  aminotransferase A  44.53 
 
 
387 aa  359  6e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2710  aminotransferase A  44.88 
 
 
387 aa  358  9e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4115  aminotransferase A  44.79 
 
 
387 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3766  aminotransferase A  44.53 
 
 
387 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4027  aminotransferase A  44.53 
 
 
387 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3918  aminotransferase A  44.27 
 
 
387 aa  354  2e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4225  aminotransferase A  44.27 
 
 
387 aa  354  2e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0316  aminotransferase A  41.25 
 
 
398 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.125137  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2836  aminotransferase class I and II  41.01 
 
 
387 aa  308  1.0000000000000001e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.04752  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1232  aminotransferase  42.23 
 
 
399 aa  306  3e-82  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1874  aspartate aminotransferase  39.19 
 
 
380 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2163  aminotransferase, classes I and II  38.81 
 
 
380 aa  303  4.0000000000000003e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0921  aminotransferase  40.93 
 
 
401 aa  303  4.0000000000000003e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000271022  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0931  aminotransferase A  36.75 
 
 
382 aa  300  2e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1809  aminotransferase A  37.27 
 
 
385 aa  300  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0019  aromatic amino acid aminotransferase  39.79 
 
 
391 aa  296  4e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0735711  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  40.48 
 
 
370 aa  296  4e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  41.76 
 
 
392 aa  295  1e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0046  aromatic amino acid aminotransferase  40.84 
 
 
391 aa  293  5e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0104565  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  41.19 
 
 
387 aa  291  1e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  38.89 
 
 
385 aa  290  3e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  41.78 
 
 
379 aa  290  4e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0045  aromatic amino acid aminotransferase  39.63 
 
 
391 aa  289  7e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0617  aminotransferase  39.52 
 
 
394 aa  285  9e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  41.4 
 
 
397 aa  285  9e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1108  aminotransferase, class I and II  39.02 
 
 
384 aa  285  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00053469  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1131  aminotransferase class I and II  39.02 
 
 
384 aa  285  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220252  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  41.13 
 
 
397 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28200  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  38.26 
 
 
379 aa  281  1e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000110278  normal  0.621857 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0744  aminotransferase  40 
 
 
394 aa  280  2e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0285306  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0545  aminotransferase class I and II  40.54 
 
 
373 aa  280  3e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2243  aminotransferase  40.68 
 
 
399 aa  280  3e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0633  aminotransferase, class I  37.47 
 
 
394 aa  279  5e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0813459  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  42.42 
 
 
387 aa  279  5e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  38.67 
 
 
375 aa  278  2e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2538  aminotransferase class I and II  40.92 
 
 
373 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.408129  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  40.16 
 
 
375 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1838  aromatic amino acid aminotransferase  38.12 
 
 
397 aa  273  4.0000000000000004e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  39.11 
 
 
380 aa  271  1e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  41.21 
 
 
395 aa  271  1e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  41.14 
 
 
395 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  40.92 
 
 
395 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>