16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4152 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4152  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  259  8e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0337445  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5290  Proteinase inhibitor I42, chagasin  35.96 
 
 
117 aa  58.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.440506 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4363  putative lipoprotein  30.43 
 
 
130 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144177  normal  0.0276166 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54220  inhibitor of cysteine peptidase  29.41 
 
 
134 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.140736  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4741  inhibitor of cysteine peptidase  29.91 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0304877  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4279  secreted protein-like protein  29.57 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.568933  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4211  lipoprotein, putative  25.4 
 
 
130 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1927  hypothetical protein  28.46 
 
 
152 aa  42.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000111149  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1442  hypothetical protein  27.83 
 
 
190 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1679  hypothetical protein  23.81 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.213144 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4035  hypothetical protein  27.66 
 
 
176 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0706  hypothetical protein  26.32 
 
 
201 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4580  hypothetical protein  29.17 
 
 
130 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1809  cellulosome protein dockerin type I  28.57 
 
 
316 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.320363  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1222  secreted protein-like protein  28.04 
 
 
130 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0154871 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13870  hypothetical protein  27.48 
 
 
132 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>