46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1948 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1948  DsrM protein  100 
 
 		 332 aa  676    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.542498  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2313  Nitrate reductase gamma subunit  68.48 
 
 		 331 aa  484  1e-136  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0136  nitrate reductase, gamma subunit  65.45 
 
 		 331 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00937433  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0703  Nitrate reductase gamma subunit  63.03 
 
 		 331 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0396835  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0044  DsrM protein  63.03 
 
 		 331 aa  440  9.999999999999999e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.877712 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0037  Nitrate reductase gamma subunit  61.52 
 
 		 331 aa  434  1e-121  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1849  Nitrate reductase gamma subunit  59.7 
 
 		 331 aa  429  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000160376  normal  0.155774 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0256  Nitrate reductase gamma subunit  50.3 
 
 		 333 aa  350  3e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0235  Nitrate reductase gamma subunit  52.61 
 
 		 332 aa  330  2e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.911573  normal  0.884852 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1146  nitrate reductase, gamma subunit  50.8 
 
 		 330 aa  324  1e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.247321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1602  nitrate reductase, gamma subunit  49.39 
 
 		 330 aa  323  2e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000153702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0070  Nitrate reductase gamma subunit  49.85 
 
 		 335 aa  321  8e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.289973 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2271  nitrate reductase, gamma subunit, putative  50 
 
 		 334 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.237982  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0270  Nitrate reductase gamma subunit  49.35 
 
 		 337 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00809754  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1775  nitrate reductase, gamma subunit  48.61 
 
 		 334 aa  309  4e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.377874  normal  0.253755 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0450  nitrate reductase gamma subunit  46.36 
 
 		 342 aa  309  4e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00150566  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0451  Nitrate reductase gamma subunit  47.57 
 
 		 339 aa  261  8e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.213571  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0049  nitrate reductase, gamma subunit  31.73 
 
 		 233 aa  111  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000306057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1957  nitrate reductase, gamma subunit  31.27 
 
 		 248 aa  103  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.344796  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1659  nitrate reductase, gamma subunit  30.3 
 
 		 255 aa  102  7e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2479  putative DsrM protein  30.18 
 
 		 244 aa  97.4  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2191  Nitrate reductase gamma subunit  30.88 
 
 		 249 aa  97.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.258292  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0172  nitrate reductase, gamma subunit  28.03 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0343  nitrate reductase gamma subunit  31.84 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0242574 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0906  nitrate reductase, gamma subunit  32.34 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1528  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.24 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000209931  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1535  nitrate reductase, gamma subunit  27.67 
 
 		 262 aa  55.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2638  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.6 
 
 		 234 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1507  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.38 
 
 		 233 aa  51.2  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5681  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.38 
 
 		 254 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3199  nitrate reductase, gamma subunit  23.95 
 
 		 271 aa  49.7  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2125  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.93 
 
 		 254 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2589  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.27 
 
 		 255 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5386  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.9 
 
 		 227 aa  47.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.338397  normal  0.0191932 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1333  respiratory nitrate reductase gamma subunit  24.09 
 
 		 225 aa  47  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0075  Nitrate reductase gamma subunit  27.24 
 
 		 289 aa  46.6  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.506128  hitchhiker  0.00856354 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1228  nitrate reductase, gamma subunit  28.65 
 
 		 255 aa  46.2  0.0009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.389364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1000  respiratory nitrate reductase gamma subunit  26.5 
 
 		 231 aa  44.3  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2138  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  23.79 
 
 		 229 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1957  nitrate reductase  22.16 
 
 		 225 aa  44.3  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1974  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  23.79 
 
 		 229 aa  43.1  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3177  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  23.3 
 
 		 229 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2517  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.63 
 
 		 227 aa  43.1  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.189452  normal  0.673257 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2278  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  23.79 
 
 		 229 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.339538  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6187  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  23.53 
 
 		 242 aa  43.1  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0410952  hitchhiker  0.00730194 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2632  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.78 
 
 		 230 aa  42.7  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>