33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0720 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0720  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  524  1e-148  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000252618  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00505  hypothetical protein  36.96 
 
 
258 aa  162  4.0000000000000004e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.977673  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0757  hypothetical protein  26.07 
 
 
268 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.186442 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2525  hypothetical protein  24.55 
 
 
262 aa  76.6  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40884  predicted protein  24.53 
 
 
288 aa  77  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00671341  normal  0.871752 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1728  protein of unknown function DUF155  27.43 
 
 
263 aa  74.3  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00082913  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0757  hypothetical protein  26.24 
 
 
264 aa  73.2  0.000000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36915  predicted protein  24.25 
 
 
381 aa  72.8  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.893691  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10806  YagE family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G12110)  25.94 
 
 
515 aa  68.6  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2558  hypothetical protein  25.37 
 
 
271 aa  67  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0594  hypothetical protein  23.88 
 
 
278 aa  67  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4205  hypothetical protein  26.92 
 
 
266 aa  65.1  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.418347  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0121  hypothetical protein  23.08 
 
 
268 aa  64.3  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02721  hypothetical protein  27.31 
 
 
260 aa  64.3  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5021  hypothetical protein  19.92 
 
 
266 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.106259  normal  0.268747 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0107  hypothetical protein  23.08 
 
 
268 aa  64.3  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0640  hypothetical protein  22.78 
 
 
256 aa  63.2  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3149  hypothetical protein  23.75 
 
 
271 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50504  predicted protein  26.29 
 
 
438 aa  60.8  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0295961 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0881  hypothetical protein  23.53 
 
 
274 aa  59.7  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.849765  hitchhiker  0.00000209176 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0703  hypothetical protein  21.7 
 
 
271 aa  58.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.197614  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2060  hypothetical protein  21.95 
 
 
278 aa  57.4  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.180421  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1331  hypothetical protein  21.92 
 
 
267 aa  55.8  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0312  hypothetical protein  20.74 
 
 
254 aa  52.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000226241 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0139  hypothetical protein  20.74 
 
 
254 aa  52.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02410  cytoplasm protein, putative  20.83 
 
 
636 aa  50.1  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58312  predicted protein  26.28 
 
 
254 aa  48.5  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1501  hypothetical protein  27.12 
 
 
276 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00667866  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01800  cytoplasm protein, putative  25.56 
 
 
480 aa  45.8  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389549  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65824  nuclear division protein  23.36 
 
 
611 aa  45.8  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.360229 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3007  protein of unknown function DUF155  18.15 
 
 
274 aa  45.4  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129271 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1174  hypothetical protein  24.06 
 
 
274 aa  44.3  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0771  hypothetical protein  21.08 
 
 
266 aa  43.1  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000939246  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>