24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8229 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8229  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  211  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0099  hypothetical protein  46.67 
 
 
108 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0513827  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0809  hypothetical protein  47.5 
 
 
93 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.834583  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10484  transmembrane protein  50.67 
 
 
87 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.363329  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4330  Protein of unknown function DUF2516  37.5 
 
 
99 aa  58.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0845  cyclic nucleotide-binding  36.89 
 
 
116 aa  56.2  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.846806 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2918  hypothetical protein  32.99 
 
 
104 aa  53.9  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0486  hypothetical protein  37.5 
 
 
113 aa  53.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.526318  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4187  hypothetical protein  39.77 
 
 
97 aa  52.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02500  Protein of unknown function (DUF2516)  40.7 
 
 
99 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15354  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0946  hypothetical protein  37.93 
 
 
108 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615167  normal  0.605499 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4620  hypothetical protein  39.51 
 
 
96 aa  50.8  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6772  hypothetical protein  36.36 
 
 
107 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25648  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3411  putative integral membrane protein  41.38 
 
 
110 aa  48.5  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0886  putative integral membrane protein  44.44 
 
 
115 aa  47.4  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  hitchhiker  0.00123293 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0657  hypothetical protein  46.38 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0721883  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0644  hypothetical protein  46.38 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.175104  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3024  hypothetical protein  38.54 
 
 
105 aa  45.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0637  hypothetical protein  46.38 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.102221  normal  0.0409068 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0381  hypothetical protein  33.33 
 
 
105 aa  45.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0467572 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0842  hypothetical protein  42.11 
 
 
100 aa  43.9  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25720  Protein of unknown function (DUF2516)  40.54 
 
 
105 aa  43.5  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0318  hypothetical protein  34.62 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0719  hypothetical protein  30.77 
 
 
117 aa  40.8  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.918882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>