More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6948 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6948  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
532 aa  1065    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0619  serine/threonine protein kinase  34.23 
 
 
589 aa  99  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3605  serine/threonine protein kinase  32.71 
 
 
481 aa  89.7  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.170818  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2507  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  27.78 
 
 
421 aa  82.4  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1299  serine/threonine protein kinase  32.35 
 
 
608 aa  82.4  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0864  serine/threonine protein kinase  33.17 
 
 
360 aa  82  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.572478  normal  0.162904 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7434  Serine/threonine protein kinase-like protein  31.06 
 
 
673 aa  81.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2847  serine/threonine protein kinase  32.88 
 
 
416 aa  80.5  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0795  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
748 aa  79.7  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0948  serine/threonine protein kinase  29.28 
 
 
734 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.21638 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4012  serine/threonine protein kinase  30.6 
 
 
528 aa  79.3  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0592  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  30.04 
 
 
603 aa  79.3  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1130  serine/threonine protein kinase  29.54 
 
 
555 aa  79  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4380  Serine/threonine protein kinase-like protein  32.1 
 
 
1153 aa  78.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594701  normal  0.339679 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8115  Serine/threonine protein kinase-like protein  35.32 
 
 
438 aa  77.8  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311057  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2563  serine/threonine protein kinase  34.62 
 
 
476 aa  78.2  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000933415  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1746  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.48 
 
 
1256 aa  76.6  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0406  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  34.12 
 
 
624 aa  76.6  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32580  protein kinase family protein  29.71 
 
 
637 aa  76.6  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.356943  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0083  Serine/threonine protein kinase-like protein  33.64 
 
 
761 aa  75.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0024  serine/threonine protein kinase  30.5 
 
 
572 aa  74.3  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1920  serine/threonine protein kinase  28.52 
 
 
587 aa  73.9  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0137132  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1696  serine/threonine protein kinase  35.26 
 
 
569 aa  73.9  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00691581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2305  Serine/threonine protein kinase-like protein  30.86 
 
 
617 aa  73.6  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2849  serine/threonine protein kinase  31.65 
 
 
709 aa  72.8  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.390264  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3028  serine/threonine protein kinase  32.05 
 
 
304 aa  72.8  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0618144  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03850  protein kinase family protein  32.17 
 
 
651 aa  72.4  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.13794 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5592  serine/threonine protein kinase  27.72 
 
 
721 aa  71.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.294025 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0677  serine/threonine protein kinase  31.28 
 
 
898 aa  71.2  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000321455 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.93 
 
 
833 aa  71.2  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3185  Serine/threonine protein kinase-like protein  31.77 
 
 
496 aa  71.2  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200139  normal  0.0794633 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0921  protein kinase  32.58 
 
 
651 aa  70.9  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0130475  normal  0.23221 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3742  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.73 
 
 
806 aa  70.5  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0575594  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2577  serine/threonine protein kinase  29.34 
 
 
573 aa  70.5  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8225  Serine/threonine protein kinase-like protein  31.18 
 
 
612 aa  70.5  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3419  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.95 
 
 
898 aa  70.1  0.00000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0056  serine/threonine protein kinase  29.45 
 
 
483 aa  69.3  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0129993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8116  Serine/threonine protein kinase-like protein  30.48 
 
 
654 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162228  normal  0.354016 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5943  serine/threonine protein kinase  28.85 
 
 
680 aa  69.3  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.545721  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0650  serine/threonine protein kinase  27.65 
 
 
548 aa  68.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0794789  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.53 
 
 
865 aa  68.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1947  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.65 
 
 
932 aa  69.3  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0876454  normal  0.992815 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4688  serine/threonine protein kinase  33.87 
 
 
520 aa  68.6  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414102  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3606  serine/threonine protein kinase  32.58 
 
 
637 aa  67.8  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.299495  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7433  Serine/threonine protein kinase-like protein  32.61 
 
 
664 aa  67.4  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6100  serine/threonine protein kinase  31.27 
 
 
624 aa  67.4  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0281 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2614  Serine/threonine protein kinase-like protein  29.96 
 
 
1148 aa  67.4  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3576  serine/threonine protein kinase  31.32 
 
 
473 aa  67  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0557447  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3910  serine/threonine protein kinase  29.34 
 
 
637 aa  66.6  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2062  serine/threonine protein kinase  31.25 
 
 
617 aa  66.6  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3911  serine/threonine protein kinase  30.89 
 
 
632 aa  66.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0023  serine/threonine protein kinase  32.1 
 
 
560 aa  66.6  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4730  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
564 aa  65.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6447  serine/threonine protein kinase  30 
 
 
514 aa  66.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0751813  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0531  serine/threonine protein kinase  30.19 
 
 
612 aa  66.2  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.145867 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3758  serine/threonine protein kinase  25.65 
 
 
455 aa  65.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143716  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6355  Serine/threonine protein kinase-like protein  28.79 
 
 
599 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.555336  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8117  Serine/threonine protein kinase-like protein  28.52 
 
 
733 aa  65.1  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1102  serine/threonine protein kinase  27.4 
 
 
484 aa  65.1  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0591  serine/threonine protein kinase  28.63 
 
 
837 aa  65.1  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.85194  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31690  protein kinase family protein  30.91 
 
 
643 aa  65.1  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0255  serine/threonine protein kinase  27.66 
 
 
754 aa  65.1  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0438219  normal  0.0628344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4915  serine/threonine protein kinase  29.68 
 
 
586 aa  65.1  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.636265  hitchhiker  0.00645126 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2303  serine/threonine protein kinase, putative  26.44 
 
 
529 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1298  serine/threonine protein kinase  32.37 
 
 
520 aa  64.7  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1866  serine/threonine protein kinase  32.5 
 
 
551 aa  64.3  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4796  serine/threonine protein kinase  24.81 
 
 
551 aa  63.9  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000010036  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0025  protein kinase  27.68 
 
 
368 aa  63.9  0.000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0668  Serine/threonine protein kinase-like protein  26.37 
 
 
464 aa  63.9  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2455  serine/threonine protein kinase  36.43 
 
 
533 aa  63.9  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.40306 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5981  serine/threonine protein kinase  29.12 
 
 
594 aa  63.9  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.381836  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1927  serine/threonine protein kinase  29.95 
 
 
522 aa  63.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0870  serine/threonine protein kinase  31.33 
 
 
328 aa  63.9  0.000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4260  serine/threonine protein kinase  30.98 
 
 
551 aa  63.5  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0338869  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2874  serine/threonine protein kinase  30.17 
 
 
604 aa  63.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.422639  normal  0.298046 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4005  serine/threonine protein kinase  31.75 
 
 
652 aa  63.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.599637  normal  0.402473 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3685  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.81 
 
 
657 aa  63.2  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.210183  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2848  serine/threonine protein kinase  32.11 
 
 
617 aa  62.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509331  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8619  serine/threonine protein kinase  30.35 
 
 
560 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5206  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.35 
 
 
687 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228236  normal  0.126006 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3365  protein kinase  26.12 
 
 
545 aa  62.8  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.345301  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  29.04 
 
 
642 aa  62.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0059  protein kinase  31.75 
 
 
358 aa  62  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.339419  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1756  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  27.48 
 
 
608 aa  61.6  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3577  serine/threonine protein kinase  29.92 
 
 
624 aa  62  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0586603  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2948  serine/threonine protein kinase  29.7 
 
 
638 aa  62  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6929  serine/threonine protein kinase  32.39 
 
 
352 aa  62  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1460  serine/threonine protein kinase  29.2 
 
 
611 aa  61.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.904567 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3442  Serine/threonine protein kinase-like protein  30.88 
 
 
529 aa  61.6  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.130924  normal  0.310599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8723  serine/threonine protein kinase  29.17 
 
 
770 aa  61.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196332  normal  0.0764847 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8080  Serine/threonine protein kinase-like protein  32.2 
 
 
726 aa  61.2  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5221  serine/threonine protein kinase  26.78 
 
 
716 aa  60.8  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0344538  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0163  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  33.91 
 
 
569 aa  60.5  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.910763  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3395  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.76 
 
 
729 aa  60.5  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0235207  normal  0.820289 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1517  serine/threonine protein kinase  28.35 
 
 
547 aa  60.5  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00657769  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1602  protein serine/threonine phosphatase  26.45 
 
 
556 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.022391  hitchhiker  0.00581256 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1141  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  30.54 
 
 
304 aa  60.1  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470867  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2662  Serine/threonine protein kinase-like protein  31.16 
 
 
814 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00893552  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.31 
 
 
668 aa  60.1  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2448  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.96 
 
 
641 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0505628 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>