71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6465 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6465  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
164 aa  338  2e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.124478  normal  0.494371 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3019  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.11 
 
 
180 aa  105  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0992  hypothetical protein  40.13 
 
 
185 aa  103  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7428  ring-cleavage extradiol dioxygenase  38 
 
 
177 aa  99.8  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0442338  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5718  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.84 
 
 
183 aa  93.6  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1001  putative ring-cleavage dioxygenase  39.07 
 
 
180 aa  91.3  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4122  hypothetical protein  34.5 
 
 
195 aa  82.8  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0255655  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0444  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.66 
 
 
320 aa  60.5  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.399259  decreased coverage  0.00429579 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5200  putative glyoxalase/bleomycin resistance protein/dihydroxybiphenyl dioxygenase  32.58 
 
 
201 aa  53.9  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000172312  normal  0.0747764 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0340  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  35.2 
 
 
328 aa  53.1  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1455  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.58 
 
 
173 aa  50.8  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4442  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  31.45 
 
 
326 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.266673 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2053  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.12 
 
 
181 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.573082  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20010  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  38.64 
 
 
388 aa  48.9  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3736  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.6 
 
 
153 aa  48.5  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4570  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.06 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.623689  normal  0.46324 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4705  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.06 
 
 
137 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00068361 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0728  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.06 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.570083  normal  0.0191793 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7651  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.28 
 
 
204 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.281044  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4704  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.06 
 
 
139 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.435252  normal  0.0441285 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2070  hypothetical protein  32.54 
 
 
131 aa  47  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765991  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3467  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD  29.03 
 
 
326 aa  46.2  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2506  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  30.95 
 
 
326 aa  45.8  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.445473  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29360  glyoxalase, Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily  30.23 
 
 
135 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3311  extradiol ring-cleavage dioxygenase family protein  41.79 
 
 
311 aa  45.1  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1487  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.78 
 
 
201 aa  45.1  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5687  catechol 2,3-dioxygenase  27.42 
 
 
314 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.581242  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1740  putative ring-cleaving dioxygenase  28.21 
 
 
137 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2159  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.87 
 
 
137 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127452  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20240  putative ring-cleaving dioxygenase  28.21 
 
 
137 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.504368  normal  0.859939 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6490  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.69 
 
 
171 aa  44.3  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.89958  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6725  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.69 
 
 
171 aa  44.3  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3865  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.15 
 
 
299 aa  44.3  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1183  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.38 
 
 
169 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3172  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.37 
 
 
137 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000657624  decreased coverage  0.000000082582 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0147  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.5 
 
 
169 aa  43.9  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0552719 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2789  catechol 2,3-dioxygenase  28.72 
 
 
314 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.33846 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3112  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  28.03 
 
 
327 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3153  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.37 
 
 
137 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  unclonable  0.0000000000010528  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2540  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.37 
 
 
137 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310756  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1387  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.45 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.94622  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0195  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.06 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2019  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.14 
 
 
176 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.92062  normal  0.0694487 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3300  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.46 
 
 
139 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3146  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.03 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.0000000000000451164  unclonable  0.00000000000414135 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2597  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.73 
 
 
268 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0559323  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2545  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.73 
 
 
268 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0159535  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1702  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.21 
 
 
136 aa  42.4  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0946955 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4885  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.24 
 
 
150 aa  42.4  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3356  catechol 2,3 dioxygenase  28.72 
 
 
314 aa  42.4  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3548  catechol 2,3 dioxygenase  27.66 
 
 
314 aa  42  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.15689  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0866  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  36.36 
 
 
363 aa  42  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0669494  normal  0.20827 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1756  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.72 
 
 
305 aa  42  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4624  catechol 2,3 dioxygenase  27.66 
 
 
314 aa  42  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1324  catechol 2,3-dioxygenase  27.84 
 
 
314 aa  41.6  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173325  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0892  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.03 
 
 
159 aa  41.2  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.088352 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3206  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 
143 aa  41.2  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000404623  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4999  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.57 
 
 
125 aa  41.2  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.921626  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3090  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 
137 aa  41.2  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000000152154  decreased coverage  0.00078643 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0115  glyoxalase family protein  30.89 
 
 
138 aa  41.2  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.000000000000344124  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0114  glyoxalase family protein  30.89 
 
 
138 aa  41.2  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.000000000210861  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0321  glyoxalase family protein  30.89 
 
 
138 aa  41.2  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000322119  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2837  glyoxalase family protein  30.89 
 
 
138 aa  41.2  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000107738  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2248  glyoxalase family protein  30.89 
 
 
138 aa  41.2  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000384082  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0131  glyoxalase family protein  30.89 
 
 
138 aa  41.2  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.0000275668  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2299  glyoxalase family protein  30.89 
 
 
138 aa  41.2  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000195056  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2322  glyoxalase family protein  30.89 
 
 
138 aa  41.2  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000000100252  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3544  Catechol 2,3-dioxygenase  24.62 
 
 
339 aa  40.8  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0967  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  30.53 
 
 
327 aa  41.2  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0214  catechol 2,3-dioxygenase  26.6 
 
 
314 aa  40.8  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.368491  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5788  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.1 
 
 
155 aa  40.8  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0683068  normal  0.880784 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>