36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5379 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5379  putative 3-carboxymuconate cyclase  100 
 
 		 364 aa  696    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228973 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0259  putative 3-carboxymuconate cyclase  37.4 
 
 		 375 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1686  hypothetical protein  30.84 
 
 		 359 aa  126  7e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0479604  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6277  hypothetical protein  35.45 
 
 		 382 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.853804 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1703  hypothetical protein  28.4 
 
 		 357 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1704  hypothetical protein  30.53 
 
 		 359 aa  112  9e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2811  hypothetical protein  30.9 
 
 		 369 aa  109  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.89144  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4891  hypothetical protein  26.04 
 
 		 434 aa  63.5  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  31.02 
 
 		 354 aa  53.1  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3976  hypothetical protein  29.17 
 
 		 353 aa  50.4  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27 
 
 		 320 aa  49.7  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2379  6-phosphogluconolactonase  28.57 
 
 		 352 aa  48.9  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.799827 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3595  hypothetical protein  28.68 
 
 		 379 aa  49.3  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3971  hypothetical protein  30.18 
 
 		 377 aa  48.5  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4419  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.78 
 
 		 1170 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.834695  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  30.69 
 
 		 354 aa  47.4  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1258  6-phosphogluconolactonase  24.7 
 
 		 331 aa  46.6  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0025  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.28 
 
 		 522 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.932986 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0020  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30 
 
 		 521 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0723  putative secreted protein  28.24 
 
 		 365 aa  45.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.780162 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0870  6-phosphogluconolactonase  22.58 
 
 		 331 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.923761 
 
 
-
 
NC_003296  RS01887  putative hemagglutinin-related protein  30.63 
 
 		 446 aa  45.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0790  6-phosphogluconolactonase  23.21 
 
 		 331 aa  44.3  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.971617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2895  6-phosphogluconolactonase  23.08 
 
 		 331 aa  44.3  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0212096  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0794  6-phosphogluconolactonase  23.08 
 
 		 331 aa  44.3  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0821  6-phosphogluconolactonase  23.08 
 
 		 331 aa  44.3  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6297  hypothetical protein  35.29 
 
 		 367 aa  44.3  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1302  hypothetical protein  23.81 
 
 		 364 aa  44.3  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.127226  normal  0.259109 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2875  6-phosphogluconolactonase  23.08 
 
 		 331 aa  44.3  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000192963  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3685  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  36.07 
 
 		 384 aa  43.9  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2090  6-phosphogluconolactonase  26.04 
 
 		 385 aa  43.5  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0876592 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4743  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.8 
 
 		 457 aa  43.9  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3263  hypothetical protein  31.97 
 
 		 487 aa  43.5  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000325549  normal  0.271166 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4202  6-phosphogluconolactonase  32.43 
 
 		 348 aa  43.1  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0130  putative 6-phosphogluconolactonase  28 
 
 		 414 aa  43.1  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0539919 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2591  6-phosphogluconolactonase  23.08 
 
 		 331 aa  42.7  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>