17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5189 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5189  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 265 aa  503  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258155  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3982  DSBA oxidoreductase  42.2 
 
 		 328 aa  187  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0904  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  43.75 
 
 		 334 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0670  TPR repeat-containing protein  48.08 
 
 		 127 aa  73.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32270  hypothetical protein  46 
 
 		 138 aa  74.3  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.265116  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0436  tetratricopeptide domain-containing protein  46.99 
 
 		 120 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.122916  hitchhiker  0.0000856563 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2037  hypothetical protein  44.21 
 
 		 154 aa  65.1  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0732088  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0366  hypothetical protein  45.78 
 
 		 120 aa  64.7  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2133  hypothetical protein  40.7 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.420216  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3081  hypothetical protein  51.61 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.298167  normal  0.458032 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3305  hypothetical protein  35.96 
 
 		 108 aa  57  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4164  hypothetical protein  39.24 
 
 		 105 aa  54.3  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0854  Tetratricopeptide domain protein  53.12 
 
 		 122 aa  52.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.679313  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0578  hypothetical protein  37.5 
 
 		 106 aa  50.4  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.67116  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03140  hypothetical protein  40 
 
 		 129 aa  50.4  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3164  hypothetical protein  29.03 
 
 		 233 aa  42.7  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0427407  normal  0.28931 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6005  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 212 aa  42.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.440782 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>