35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3326 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3326  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  100 
 
 
207 aa  401  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2548  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  41.61 
 
 
190 aa  119  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7183  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  36.71 
 
 
190 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2678  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  36.55 
 
 
187 aa  90.1  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.027018 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2793  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  36.17 
 
 
185 aa  87.8  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0769418  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2776  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.5 
 
 
184 aa  87.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1807  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.02 
 
 
194 aa  76.3  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0985875  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3800  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.79 
 
 
187 aa  75.9  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000606803 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08638  HHE domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G00730)  29.2 
 
 
228 aa  70.1  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000349477  normal  0.759451 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4867  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.41 
 
 
158 aa  70.1  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00231267  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5414  hypothetical protein  32.65 
 
 
157 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02980  conserved hypothetical protein  28.33 
 
 
220 aa  57  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.959027  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4750  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.29 
 
 
190 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.777475  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4232  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.36 
 
 
178 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4679  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  35.71 
 
 
235 aa  53.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3504  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.07 
 
 
271 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.033907  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4614  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.87 
 
 
185 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178279  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2549  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.66 
 
 
165 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4302  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.23 
 
 
171 aa  52.8  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2453  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.39 
 
 
165 aa  52  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4844  cyclase/dehydrase  27.46 
 
 
328 aa  52  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.327815  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0733  hypothetical protein  27.13 
 
 
195 aa  50.1  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.21283  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5558  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.43 
 
 
188 aa  48.9  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.418641 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0362  hypothetical protein  30.33 
 
 
162 aa  48.9  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5496  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.17 
 
 
184 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2480  hypothetical protein  29.19 
 
 
177 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0435976  normal  0.540036 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2248  hypothetical protein  23.46 
 
 
161 aa  46.6  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3879  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25 
 
 
165 aa  45.8  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1404  hemerythrin HHE cation binding protein  28.39 
 
 
165 aa  45.4  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3999  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.71 
 
 
202 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2004  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.17 
 
 
151 aa  42.4  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1486  hemerythrin HHE cation binding region  25 
 
 
168 aa  42.7  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1421  hemerythrin HHE cation binding region protein  26.45 
 
 
178 aa  42.4  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001938  hypothetical protein  32.26 
 
 
143 aa  42  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2007  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.71 
 
 
164 aa  41.6  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>