174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3229 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_3229  acetyltransferase  100 
 
 
160 aa  329  1e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0958229  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2991  GCN5-related N-acetyltransferase  53.46 
 
 
163 aa  193  8.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2066  GCN5-related N-acetyltransferase  54.37 
 
 
160 aa  192  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3124  acetyltransferase, GNAT family  50.94 
 
 
163 aa  187  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0505019  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2581  GCN5-related N-acetyltransferase  52.83 
 
 
165 aa  180  9.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246778  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0111  GCN5-related N-acetyltransferase  51.27 
 
 
160 aa  178  2.9999999999999997e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.316661  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2590  GCN5-related N-acetyltransferase  47.47 
 
 
173 aa  164  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.391123  normal  0.420141 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2014  GCN5-related N-acetyltransferase  46.06 
 
 
173 aa  155  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2214  GCN5-related N-acetyltransferase  44.3 
 
 
167 aa  154  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0813  putative acetyltransferase  44.3 
 
 
161 aa  152  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.425962  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2627  GCN5-related N-acetyltransferase  47.47 
 
 
159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1313  putative acetyltransferase  48.05 
 
 
163 aa  150  5.9999999999999996e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.338207  normal  0.391581 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0418  acetyltransferase  42.14 
 
 
184 aa  131  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0657723 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2615  GCN5-related N-acetyltransferase  43.04 
 
 
160 aa  128  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3005  acetyltransferase, GNAT family  43.04 
 
 
160 aa  128  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1601  GCN5-related N-acetyltransferase  33.64 
 
 
165 aa  57  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1896  GCN5-related N-acetyltransferase  40.54 
 
 
151 aa  55.8  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2132  diamine acetyltransferase  30.16 
 
 
178 aa  55.1  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.105649  normal  0.341096 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2432  GCN5-related N-acetyltransferase  31.68 
 
 
176 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2838  GCN5-related N-acetyltransferase  31.68 
 
 
176 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1584  GCN5-related N-acetyltransferase  31.68 
 
 
157 aa  53.9  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0515771 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0526  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
170 aa  52  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2855  GCN5-related N-acetyltransferase  34.02 
 
 
173 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3984  GCN5-like N-acetyltransferase  30.28 
 
 
163 aa  51.6  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2565  putative acetyltransferase protein  28.69 
 
 
177 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0561  putative acetyltransferase  34.02 
 
 
161 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1199  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 
164 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1156  acetyltransferase  37.93 
 
 
369 aa  50.4  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0312  GCN5-related N-acetyltransferase  30.84 
 
 
168 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.648752  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0937  GCN5-related N-acetyltransferase  28.28 
 
 
160 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.158897  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0591  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
171 aa  50.1  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33160  acetyltransferase (GNAT) family protein  34.12 
 
 
143 aa  50.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0204184  normal  0.66835 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2151  GCN5-related N-acetyltransferase  35.44 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.673137  normal  0.0183751 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1874  acetyltransferase  46.15 
 
 
165 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.39507  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1241  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
162 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.595226 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2168  acetyltransferase, GNAT family  30.28 
 
 
165 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.55382  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0798  GCN5-related N-acetyltransferase  26.09 
 
 
174 aa  48.9  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.631657  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0976  GCN5-related N-acetyltransferase  32.65 
 
 
170 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.416223 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2140  acetyltransferase  30.28 
 
 
217 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.140339  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1922  acetyltransferase  46.15 
 
 
168 aa  48.5  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.277124  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1051  GCN5-related N-acetyltransferase  29 
 
 
169 aa  48.5  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0453046 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1884  acetyltransferase  46.15 
 
 
168 aa  48.5  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.364881  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2069  acetyltransferase  46.15 
 
 
165 aa  48.5  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2100  acetyltransferase, GNAT family  46.15 
 
 
165 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4576  GCN5-related N-acetyltransferase  28.46 
 
 
163 aa  48.5  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0649129  normal  0.528305 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1564  GCN5-related N-acetyltransferase  28.68 
 
 
179 aa  48.1  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000684291  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3250  acetyltransferase, GNAT family  32.11 
 
 
165 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000015157  normal  0.297899 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0886  acetyltransferase  27.43 
 
 
165 aa  47.8  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1197  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 
198 aa  47.8  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1918  GCN5-related N-acetyltransferase  46.15 
 
 
165 aa  47.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0771647  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2240  GCN5-related N-acetyltransferase  34.21 
 
 
237 aa  47.4  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5735  GCN5-related N-acetyltransferase  29.2 
 
 
165 aa  47.4  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.77189  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2058  acetyltransferase, GNAT family  30.56 
 
 
165 aa  47.4  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00654111  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0218  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  42.86 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0003  GCN5-related N-acetyltransferase  34.44 
 
 
320 aa  47  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4425  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
173 aa  46.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1528  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
154 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0703  GCN5-related N-acetyltransferase  28.28 
 
 
160 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.04 
 
 
156 aa  47  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1556  GCN5-related N-acetyltransferase  27.52 
 
 
168 aa  47  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0661406  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0500  GCN5-related N-acetyltransferase  29.69 
 
 
168 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0159  GCN5-related N-acetyltransferase  30.49 
 
 
162 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0205255  normal  0.0268459 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0376  GCN5-related N-acetyltransferase  29 
 
 
133 aa  46.6  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1850  GCN5-related N-acetyltransferase  31.65 
 
 
160 aa  46.2  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0408298  normal  0.531787 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0163  GCN5-related N-acetyltransferase  30.49 
 
 
162 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1099  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.29 
 
 
150 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3689  GCN5-related N-acetyltransferase  32.65 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.950669  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1393  GCN5-related N-acetyltransferase  29.76 
 
 
168 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.232677  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2318  GCN5-related N-acetyltransferase  30.09 
 
 
165 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253918  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2453  GCN5-related N-acetyltransferase  30.09 
 
 
165 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00150599  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2408  GCN5-related N-acetyltransferase  27.43 
 
 
165 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0178488  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0267  GCN5-related N-acetyltransferase  32.77 
 
 
181 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122912 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3791  GCN5-related N-acetyltransferase  31.08 
 
 
168 aa  45.8  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00503976  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0957  putative acetyltransferase  35.35 
 
 
174 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554989  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2412  GCN5-related N-acetyltransferase  27.43 
 
 
165 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700134 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06250  GNAT family acetyltransferase  28.57 
 
 
158 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129837  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0935  acetyltransferase  31.25 
 
 
173 aa  44.7  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000592178  normal  0.287398 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2893  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  32.35 
 
 
181 aa  44.7  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1796  GCN5-related N-acetyltransferase  27.43 
 
 
195 aa  44.7  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0149  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.09 
 
 
156 aa  44.7  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.182937  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4433  GCN5-related N-acetyltransferase  45.1 
 
 
153 aa  44.7  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.593041  normal  0.64784 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0245  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  42.86 
 
 
159 aa  44.7  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1615  GCN5-related N-acetyltransferase  25.48 
 
 
154 aa  43.9  0.0009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04470  acetyltransferase (GNAT) family protein  26.73 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0776164  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2849  acetyltransferase  26.92 
 
 
153 aa  43.9  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2210  GCN5-related N-acetyltransferase  25.93 
 
 
178 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.236842  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0246  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  42.86 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1389  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
212 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00377993  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4231  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3030  GCN5-related N-acetyltransferase  32.32 
 
 
174 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25589  hitchhiker  0.00490416 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0666  GCN5-related N-acetyltransferase  36.14 
 
 
185 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0260  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  42.86 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.696152  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1015  GCN5-related N-acetyltransferase  26.61 
 
 
165 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000526806 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0864  GCN5-related N-acetyltransferase  30.59 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1774  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  32.91 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.34696  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0414  GCN5-related N-acetyltransferase  26.42 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.808997 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0274  GCN5-related N-acetyltransferase  26.52 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1834  GCN5-related N-acetyltransferase  26.73 
 
 
131 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0309  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
169 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0371  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.06 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>