48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0252 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0252  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 70 aa  143  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0384  sulfur carrier protein ThiS  44.29 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3574  sulfur carrier protein ThiS  44.29 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000430861 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1981  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 		 70 aa  53.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00036905  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2239  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.57 
 
 		 70 aa  51.2  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.423585 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2773  sulfur carrier protein ThiS  41.43 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374712  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0216  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.14 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1459  hypothetical protein  35.71 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0207  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.71 
 
 		 65 aa  45.4  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.549071  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6223  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.71 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3292  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.43 
 
 		 65 aa  44.7  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212717 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4172  sulfur carrier protein ThiS  34.29 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.455905 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1774  sulfur carrier protein ThiS  34.29 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2779  sulfur carrier protein ThiS  34.29 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3738  sulfur carrier protein ThiS  34.29 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3680  sulfur carrier protein ThiS  34.29 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3225  sulfur carrier protein ThiS  34.29 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2729  sulfur carrier protein ThiS  34.29 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3709  sulfur carrier protein ThiS  34.29 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0411  sulfur carrier protein ThiS  35.71 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0589  hypothetical protein  35.71 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.519327  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0390  sulfur carrier protein ThiS  35.71 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4093  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.57 
 
 		 65 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467775  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2696  sulfur carrier protein ThiS  35.71 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0146  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.03 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3509  sulfur carrier protein ThiS  35.71 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.20038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1043  ThiS, thiamine-biosynthesis  36.62 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1524  hypothetical protein  32.86 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1933  thiamine biosynthesis protein ThiS  30 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0329  sulfur carrier protein ThiS  35.71 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.78 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.153528  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0314  sulfur carrier protein ThiS  34.29 
 
 		 65 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.388373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0338  sulfur carrier protein ThiS  35.71 
 
 		 65 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.518448  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3007  sulfur carrier protein ThiS  32.86 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3034  thiamine biosynthesis protein ThiS  32 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295138  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3658  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.29 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7517  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.57 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12799  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0093  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.704796  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6770  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.58 
 
 		 70 aa  40.4  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0040  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.57 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  35.71 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0667  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.14 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.20728e-26 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2782  putative thiamine biosynthesis protein ThiS  30 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408989  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  35.71 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1415  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.71 
 
 		 65 aa  40.4  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3887  thiamine biosynthesis protein ThiS  30 
 
 		 66 aa  40.4  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  35.71 
 
 		 66 aa  40  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3944  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.43 
 
 		 71 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000530679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>