74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0425 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0425  major facilitator family protein  100 
 
 		 428 aa  848    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.950932  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0068  major facilitator superfamily MFS_1  47.46 
 
 		 419 aa  394  1e-108  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.774441  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4860  major facilitator family protein CglT  42.31 
 
 		 422 aa  348  1e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03759  predicted transporter  38.7 
 
 		 421 aa  270  5e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.403502  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03708  hypothetical protein  38.7 
 
 		 421 aa  270  5e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.450457  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4259  major facilitator transporter  38.7 
 
 		 421 aa  270  5e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4142  major facilitator transporter  38.7 
 
 		 421 aa  270  5e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.810342 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4101  major facilitator transporter  38.7 
 
 		 421 aa  270  5e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4397  major facilitator transporter  38.46 
 
 		 421 aa  269  8.999999999999999e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4112  major facilitator superfamily MFS_1  38.7 
 
 		 421 aa  268  1e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5320  transporter, major facilitator family  38.46 
 
 		 421 aa  268  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.581076  normal  0.378409 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3580  major facilitator transporter  37.44 
 
 		 421 aa  255  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.177538 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2061  major facilitator family protein  35.4 
 
 		 417 aa  232  9e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2836  major facilitator transporter  31.6 
 
 		 448 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647755  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1836  major facilitator superfamily MFS_1  31.75 
 
 		 438 aa  215  9.999999999999999e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4031  major facilitator family transporter  30.34 
 
 		 425 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.80085  normal  0.402393 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2903  major facilitator family transporter  30.8 
 
 		 425 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.173652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3076  major facilitator family transporter  30.34 
 
 		 425 aa  211  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00169056  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0914  major facilitator superfamily MFS_1  30.57 
 
 		 425 aa  210  4e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.385609  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02582  hypothetical protein  30.57 
 
 		 425 aa  210  4e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0938  major facilitator transporter  30.57 
 
 		 425 aa  210  4e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.90207  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02619  predicted transporter  30.57 
 
 		 425 aa  210  4e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2914  major facilitator family transporter  30.11 
 
 		 425 aa  209  8e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2463  major facilitator transporter  31.12 
 
 		 427 aa  207  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1991  major facilitator superfamily MFS_1  30.64 
 
 		 440 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.359868 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07155  hypothetical protein  31.18 
 
 		 428 aa  186  7e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2908  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 423 aa  176  7e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0278927 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0338  MFS transporter  28.47 
 
 		 427 aa  170  5e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0543879  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3299  major facilitator transporter  29.28 
 
 		 433 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3509  major facilitator transporter  42.05 
 
 		 214 aa  157  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.36765  normal  0.167547 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2823  major facilitator transporter  36.04 
 
 		 207 aa  132  7.999999999999999e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0137  hypothetical protein  24.44 
 
 		 497 aa  94.7  3e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1586  major facilitator superfamily permease  25 
 
 		 461 aa  90.1  7e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000240166  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0138  hypothetical protein  23.37 
 
 		 483 aa  83.2  0.000000000000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1683  hypothetical protein  43.9 
 
 		 82 aa  69.7  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1684  hypothetical protein  45.95 
 
 		 90 aa  63.2  0.000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  20.05 
 
 		 441 aa  57  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0577  glycerol-3-phosphate transporter  21.98 
 
 		 448 aa  55.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1681  hypothetical protein  38.46 
 
 		 103 aa  53.9  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1682  hypothetical protein  30.48 
 
 		 123 aa  50.4  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  22.08 
 
 		 430 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  22.83 
 
 		 449 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6215  major facilitator transporter  23.65 
 
 		 417 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0680  major facilitator family transporter  20.3 
 
 		 443 aa  47  0.0006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  26.47 
 
 		 437 aa  47  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0688  hypothetical protein  22.08 
 
 		 430 aa  47  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0691  hypothetical protein  22.67 
 
 		 423 aa  46.6  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0707  hypothetical protein  20.76 
 
 		 425 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  26.39 
 
 		 434 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  21.25 
 
 		 420 aa  45.8  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0689  hypothetical protein  20.76 
 
 		 425 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  21.5 
 
 		 432 aa  46.2  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3300  L-fucose transporter  40.51 
 
 		 438 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3120  L-fucose transporter  40.51 
 
 		 438 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.38497  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3137  L-fucose transporter  40.51 
 
 		 438 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.436667 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3200  L-fucose transporter  40.51 
 
 		 438 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3185  L-fucose transporter  40.51 
 
 		 438 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  22.67 
 
 		 406 aa  45.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1497  transporter, MFS superfamily  20 
 
 		 443 aa  45.8  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0887  L-fucose transporter  39.24 
 
 		 438 aa  45.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4065  L-fucose transporter  39.24 
 
 		 438 aa  45.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2945  L-fucose transporter  39.24 
 
 		 438 aa  45.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0911  L-fucose transporter  39.24 
 
 		 438 aa  45.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2942  L-fucose transporter  39.24 
 
 		 438 aa  45.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3106  L-fucose transporter  39.24 
 
 		 438 aa  45.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101933  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0674  hypothetical protein  22.42 
 
 		 423 aa  44.7  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7147  major facilitator superfamily MFS_1  21.26 
 
 		 430 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94723  MFS family transporter: glycerol-3-phosphate  22.63 
 
 		 424 aa  44.3  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.000449836 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1424  major facilitator superfamily MFS_1  28.74 
 
 		 850 aa  44.3  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.314854 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0246  major facilitator superfamily MFS_1  22.61 
 
 		 444 aa  44.3  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2041  major facilitator superfamily MFS_1  24.79 
 
 		 397 aa  43.9  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.088026  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  20.51 
 
 		 433 aa  43.5  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  22.69 
 
 		 445 aa  43.5  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 434 aa  43.1  0.009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>