More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNG01490 on replicon NC_006692
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006692  CNG01490  transaminase, putative  100 
 
 
513 aa  1066    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01923  alanine transaminase (Eurofung)  49.71 
 
 
555 aa  473  1e-132  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0148319 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70108  alanine transaminase (ALAM)  46.72 
 
 
509 aa  442  1e-123  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.301936  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34010  predicted protein  43.1 
 
 
475 aa  398  1e-109  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.333756  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2006  aminotransferase class I and II  40.37 
 
 
457 aa  358  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.37575  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30612  predicted protein  39.96 
 
 
473 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1237  aminotransferase AlaT  28.35 
 
 
412 aa  143  8e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0169651 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1458  aminotransferase  28.53 
 
 
404 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0461  aminotransferase class I and II  28.79 
 
 
418 aa  141  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1262  aminotransferase AlaT  26.84 
 
 
429 aa  140  7e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.30879  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1201  aminotransferase AlaT  26.84 
 
 
413 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.895209  normal  0.0291272 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1540  aminotransferase AlaT  26.04 
 
 
409 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.790745 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1967  aminotransferase AlaT  25 
 
 
409 aa  136  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000390932  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01427  aminotransferase AlaT  27.57 
 
 
404 aa  136  9e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0691  aminotransferase class I and II  28.61 
 
 
410 aa  135  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0228341  hitchhiker  0.0000000562842 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2197  aminotransferase AlaT  26.44 
 
 
412 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141545  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004034  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  27.57 
 
 
377 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0437  aminotransferase AlaT  26.56 
 
 
418 aa  135  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1326  aminotransferase AlaT  25.79 
 
 
413 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0763036  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1911  aminotransferase AlaT  28.08 
 
 
426 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2382  aminotransferase AlaT  28.24 
 
 
416 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.378637  normal  0.475117 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1660  aminotransferase class I and II  28.34 
 
 
404 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0618  aminotransferase AlaT  28.11 
 
 
426 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.647931  normal  0.109803 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05990  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  29.54 
 
 
415 aa  134  3e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.338799  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1805  aminotransferase AlaT  27.27 
 
 
416 aa  134  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.605572  hitchhiker  0.00221354 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1994  aminotransferase AlaT  25.46 
 
 
427 aa  133  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5220  aminotransferase AlaT  27.23 
 
 
411 aa  132  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0739506  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1772  aminotransferase AlaT  26.74 
 
 
404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3207  aminotransferase AlaT  27.23 
 
 
410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0064  aminotransferase AlaT  28.31 
 
 
415 aa  131  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0930  aminotransferase AlaT  27.75 
 
 
415 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.703873  normal  0.497759 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2026  aminotransferase AlaT  25.33 
 
 
409 aa  130  5.0000000000000004e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1781  aminotransferase class I and II  26.74 
 
 
405 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1565  aminotransferase class I and II  27.79 
 
 
404 aa  130  6e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114117  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1830  aminotransferase AlaT  28.12 
 
 
409 aa  130  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0279  aminotransferase AlaT  26.96 
 
 
422 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.306917  normal  0.798305 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1097  aminotransferase AlaT  26.67 
 
 
404 aa  127  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.832418  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1907  aminotransferase AlaT  27.7 
 
 
404 aa  128  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0371562  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10342  aminotransferase AlaT  27.42 
 
 
429 aa  127  5e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.535364  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2560  aminotransferase AlaT  26.77 
 
 
410 aa  127  6e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.752509  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4338  aminotransferase class I and II  26.42 
 
 
440 aa  127  7e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2553  aminotransferase AlaT  27.45 
 
 
406 aa  126  8.000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000352326 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2232  aminotransferase AlaT  25.59 
 
 
407 aa  126  9e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0248058  hitchhiker  0.00000226565 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2271  aminotransferase AlaT  27.35 
 
 
412 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1563  aminotransferase AlaT  26.56 
 
 
404 aa  125  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2189  aminotransferase AlaT  28.07 
 
 
407 aa  126  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662923  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0441  aminotransferase AlaT  27.88 
 
 
428 aa  126  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.283674  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2233  aminotransferase AlaT  27.35 
 
 
412 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0428  aminotransferase AlaT  27.88 
 
 
428 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249561  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0451  aminotransferase AlaT  27.88 
 
 
428 aa  126  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.343085  normal  0.024281 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2397  aminotransferase AlaT  27.35 
 
 
415 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1803  aminotransferase class I and II  27.97 
 
 
416 aa  125  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01072  aminotransferase AlaT  25.34 
 
 
406 aa  124  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0842  aminotransferase AlaT  27.35 
 
 
426 aa  124  3e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.387526  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7259  aminotransferase AlaT  25.8 
 
 
404 aa  124  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2387  aminotransferase AlaT  24.27 
 
 
414 aa  124  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2662  aminotransferase AlaT  27.59 
 
 
409 aa  124  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3232  aminotransferase AlaT  25.88 
 
 
411 aa  124  5e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00114602  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1697  aminotransferase AlaT  27.78 
 
 
404 aa  124  5e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00135773  normal  0.0103936 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2838  aminotransferase AlaT  26.9 
 
 
406 aa  123  8e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00546919  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1993  aminotransferase AlaT  27.39 
 
 
404 aa  123  9e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000340923  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2579  aminotransferase AlaT  24.89 
 
 
435 aa  123  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2340  aminotransferase AlaT  27.93 
 
 
404 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.599264  hitchhiker  0.0000284015 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1475  aminotransferase AlaT  25.17 
 
 
404 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.714124 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2483  aminotransferase AlaT  28.23 
 
 
404 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5139  aminotransferase class I and II  25.58 
 
 
405 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0815  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  25.29 
 
 
543 aa  121  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000101796  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1935  aminotransferase AlaT  28.23 
 
 
404 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00236574  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3366  aminotransferase AlaT  25.47 
 
 
432 aa  120  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0717  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  24.68 
 
 
546 aa  120  6e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.890628  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1914  aminotransferase AlaT  26.76 
 
 
404 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000233272  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1765  aminotransferase AlaT  26.56 
 
 
412 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.436136  normal  0.213535 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0692  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  25.41 
 
 
545 aa  119  9e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4521  aminotransferase AlaT  27.7 
 
 
404 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2235  aminotransferase AlaT  27.7 
 
 
404 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000654312  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2136  aminotransferase AlaT  27.7 
 
 
404 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000003299  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1490  aminotransferase AlaT  26.2 
 
 
404 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2248  aminotransferase AlaT  27.7 
 
 
404 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000013752  hitchhiker  0.00000000752949 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1418  aminotransferase AlaT  26.44 
 
 
412 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00886152  normal  0.0522162 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2267  aminotransferase AlaT  26.86 
 
 
403 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0850565  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1164  aminotransferase AlaT  27.51 
 
 
423 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000136093 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2774  aminotransferase AlaT  26.2 
 
 
404 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.363004  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6224  aminotransferase AlaT  26.11 
 
 
412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2186  aminotransferase AlaT  27.7 
 
 
404 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0116007  hitchhiker  0.0000796171 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02420  aminotransferase AlaT  25.5 
 
 
423 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1855  aminotransferase AlaT  26.11 
 
 
412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.300188  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3601  aminotransferase AlaT  26.29 
 
 
405 aa  118  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.16413 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2723  aminotransferase class I and II  25.49 
 
 
414 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5156  aminotransferase AlaT  26.89 
 
 
412 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.32187  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1872  aminotransferase AlaT  27.7 
 
 
404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2040  aminotransferase AlaT  27.7 
 
 
404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00341686  hitchhiker  0.00762729 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1391  aminotransferase AlaT  26.39 
 
 
404 aa  117  6.9999999999999995e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0476582  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1879  aminotransferase AlaT  26.44 
 
 
412 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123534  hitchhiker  0.0000142896 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2145  aminotransferase AlaT  27.44 
 
 
404 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0123768  normal  0.013049 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2516  aminotransferase AlaT  26.03 
 
 
404 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0408382  normal  0.443228 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2559  aminotransferase AlaT  26.03 
 
 
404 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2471  aminotransferase AlaT  26.03 
 
 
404 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00191502  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2571  aminotransferase AlaT  26.03 
 
 
404 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1793  aminotransferase AlaT  26.56 
 
 
412 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0903  aminotransferase AlaT  25.33 
 
 
429 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>