27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE02970 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



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Replicon accession

Locus tag

Product

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Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

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E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006684  CNB02930    98.35 
 
 
6690 bp  4835    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.248391  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01490    96.65 
 
 
12648 bp  2874    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01470    96.25 
 
 
1707 bp  2650    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0419908  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01450    95.48 
 
 
3186 bp  898    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03090    97.93 
 
 
579 bp  1053    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.598355  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03080    98.66 
 
 
6546 bp  5741    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.589577  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03050    97.31 
 
 
2400 bp  2635    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03040    97 
 
 
6606 bp  1451    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03000    99.85 
 
 
6462 bp  2662    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00372907  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02970    100 
 
 
3063 bp  6072    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.161059  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03630    98.32 
 
 
1917 bp  2095    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.664916  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02040    97.27 
 
 
5451 bp  4787    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0657363  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01990    98.42 
 
 
4092 bp  2345    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00560    97.07 
 
 
9432 bp  2565    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00540    98.17 
 
 
10638 bp  5622    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.271423  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00520    98.49 
 
 
534 bp  989    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.0038147  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04180    95.39 
 
 
7164 bp  3223    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.192446  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04160  retrotransposon nucleocapsid protein, putative  97.44 
 
 
4245 bp  5281    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0468988  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02800    98.64 
 
 
5544 bp  5111    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03690    98.58 
 
 
7809 bp  4478    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.858163  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03190    96.48 
 
 
4905 bp  339  3e-90  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  unclonable  0.000000117128  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01460    99.12 
 
 
2397 bp  218  7e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0805614  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02780    88.46 
 
 
7383 bp  56  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0276994  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03100    96.88 
 
 
5637 bp  56  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.764766  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03680    96.88 
 
 
5499 bp  56  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03640    96.88 
 
 
6336 bp  56  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02930    100 
 
 
5061 bp  50.1  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.108967  n/a   
 
 
-
 
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