19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND06160 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006686  CND06130  conserved hypothetical protein  72.71 
 
 
599 aa  845    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.533369  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06160  conserved hypothetical protein  100 
 
 
588 aa  1215    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00380  glucosidase, putative  58.23 
 
 
623 aa  591  1e-167  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.416294  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00550  glucosidase, putative  59.67 
 
 
619 aa  581  1e-164  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00410  beta-glucan synthesis-associated protein, putative  51.21 
 
 
622 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75745  glucan synthase subunit involved in cell wall assembly  40.5 
 
 
695 aa  402  9.999999999999999e-111  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65263  glucan synthase subunit involved in cell wall assembly  42.29 
 
 
653 aa  397  1e-109  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.632986 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01640  glucosidase, putative  46.07 
 
 
834 aa  395  1e-108  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10779  putative 1,6-beta-glucan synthetase (Eurofung)  43.27 
 
 
632 aa  388  1e-106  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63619  Beta-glucan synthesis-associated protein  39.64 
 
 
482 aa  347  4e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.463894  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50238  predicted protein  28.82 
 
 
625 aa  157  6e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48300  predicted protein  37.61 
 
 
746 aa  138  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0439212  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_56509  predicted protein  26.75 
 
 
669 aa  129  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.917921  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  28.57 
 
 
383 aa  53.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54973  endo-1,3-beta-glucosidase  29.21 
 
 
467 aa  47.8  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  28.18 
 
 
389 aa  48.1  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  27.55 
 
 
1059 aa  47.4  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  26.19 
 
 
409 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  31.54 
 
 
291 aa  46.6  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.194858 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>