More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC05320 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006685  CNC05320  mitochondrial 60s ribosomal protein l38 (yml38), putative  100 
 
 		 149 aa  291  3e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06146  50S ribosomal protein L14 (AFU_orthologue; AFUA_2G08520)  51.01 
 
 		 131 aa  123  7e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00443765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89472  predicted protein  51.7 
 
 		 132 aa  123  7e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0711  50S ribosomal protein L14  42.95 
 
 		 122 aa  103  7e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121544  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0089  50S ribosomal protein L14  44.3 
 
 		 122 aa  102  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0890299 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2055  ribosomal protein L14  44.3 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000741427  normal  0.051973 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3995  ribosomal protein L14  43.62 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219417  normal  0.669985 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2247  50S ribosomal protein L14  44.3 
 
 		 122 aa  101  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000965477  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2305  50S ribosomal protein L14  44.97 
 
 		 122 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0162624  normal  0.103415 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3174  50S ribosomal protein L14  44.97 
 
 		 122 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.992271  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1343  50S ribosomal protein MRPL14P  44 
 
 		 123 aa  101  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.140973 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4924  ribosomal protein L14  42.28 
 
 		 122 aa  100  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00747276  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0187  50S ribosomal protein L14  44.67 
 
 		 122 aa  100  5e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.396504 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1755  50S ribosomal protein L14  43.62 
 
 		 122 aa  100  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.487668  normal  0.39775 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0690  50S ribosomal protein L14  42.95 
 
 		 122 aa  100  8e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.114606  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2314  50S ribosomal protein L14P  44.3 
 
 		 122 aa  100  8e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.109714  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1356  50S ribosomal protein L14  41.61 
 
 		 122 aa  100  9e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0481946  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1725  50S ribosomal protein L14  42.95 
 
 		 122 aa  100  9e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0371  50S ribosomal protein L14  42.95 
 
 		 122 aa  100  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2524  50S ribosomal protein L14  42.95 
 
 		 122 aa  100  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0499  50S ribosomal protein L14  44.3 
 
 		 122 aa  100  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000101997  decreased coverage  0.00104649 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0415  50S ribosomal protein L14  44.97 
 
 		 122 aa  99.4  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000011877  normal  0.230191 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0494  50S ribosomal protein L14  44.3 
 
 		 122 aa  100  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000512994  normal  0.0255755 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0718  50S ribosomal protein L14  44.97 
 
 		 122 aa  99.4  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248999  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1565  50S ribosomal protein L14  43.62 
 
 		 122 aa  99.8  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0857  50S ribosomal protein L14P  42.95 
 
 		 122 aa  99.8  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000045914  hitchhiker  0.000476718 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0769  50S ribosomal protein L14  42.95 
 
 		 122 aa  99.4  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.234537  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_002936  DET0484  50S ribosomal protein L14  45.77 
 
 		 122 aa  99.4  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196893  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1174  ribosomal protein L14  43.62 
 
 		 122 aa  99  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00146372  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0461  50S ribosomal protein L14  45.07 
 
 		 122 aa  99  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000117525  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1259  50S ribosomal protein L14  42.95 
 
 		 122 aa  99  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.959032  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0436  50S ribosomal protein L14  44.97 
 
 		 122 aa  99.4  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000433356  hitchhiker  0.0000995227 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3438  50S ribosomal protein L14  44.3 
 
 		 122 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286234  normal  0.516517 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0670  50S ribosomal protein L14  41.61 
 
 		 122 aa  98.6  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.170156  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2159  ribosomal protein L14  41.61 
 
 		 122 aa  98.2  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal  0.234702 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_427  ribosomal protein L14  45.07 
 
 		 122 aa  98.2  4e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1921  50S ribosomal protein L14  40.94 
 
 		 122 aa  98.2  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.547966 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5060  50S ribosomal protein L14  44.3 
 
 		 122 aa  98.2  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.750337 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3657  50S ribosomal protein L14  43.62 
 
 		 122 aa  97.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0329  50S ribosomal protein L14  44.3 
 
 		 122 aa  97.4  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.5842e-28  unclonable  0.0000000445572 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2678  50S ribosomal protein L14P  42.95 
 
 		 122 aa  97.4  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0289  50S ribosomal protein L14  44.3 
 
 		 122 aa  97.8  5e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111281  hitchhiker  0.00000195891 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1374  50S ribosomal protein L14  44.3 
 
 		 122 aa  97.4  6e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.439933  normal  0.532331 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0601  50S ribosomal protein L14  42.28 
 
 		 122 aa  97.4  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0636  50S ribosomal protein L14  43.62 
 
 		 122 aa  97.1  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143899  hitchhiker  0.0000000109372 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1555  50S ribosomal protein L14  44.3 
 
 		 122 aa  97.1  7e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05770  ribosomal protein L14  44.97 
 
 		 122 aa  97.1  7e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1223  50S ribosomal protein L14  42.95 
 
 		 122 aa  97.1  8e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1186  50S ribosomal protein L14  42.95 
 
 		 122 aa  97.1  8e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.367223  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1966  50S ribosomal protein L14  42.95 
 
 		 122 aa  97.1  8e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00306344  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1076  50S ribosomal protein L14  42.28 
 
 		 122 aa  96.7  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00057031  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0852  ribosomal protein L14  43.62 
 
 		 122 aa  96.7  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1342  50S ribosomal protein L14  42.28 
 
 		 122 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0385141  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1151  ribosomal protein L14  42.28 
 
 		 122 aa  96.3  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000029859  hitchhiker  0.000136956 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0611  ribosomal protein L14  42.28 
 
 		 122 aa  96.3  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0109418  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23370  LSU ribosomal protein L14P  45.64 
 
 		 122 aa  96.3  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000150198  hitchhiker  0.00000101977 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0443  50S ribosomal protein L14  42.95 
 
 		 122 aa  95.9  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00471045  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0305  ribosomal protein L14  42.95 
 
 		 122 aa  96.3  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000122686  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0295  50S ribosomal protein L14  42.28 
 
 		 122 aa  96.7  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.830026 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0264  50S ribosomal protein L14  42.28 
 
 		 122 aa  96.3  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.188398  normal  0.453731 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2808  50S ribosomal protein L14  42.95 
 
 		 122 aa  96.7  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.430047 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1668  50S ribosomal protein L14  43.62 
 
 		 122 aa  96.7  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0136083  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0415  50S ribosomal protein L14  45.33 
 
 		 123 aa  96.3  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0110237  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1846  ribosomal protein L14  43.62 
 
 		 122 aa  96.3  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.655249999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3514  ribosomal protein L14  42.28 
 
 		 122 aa  96.7  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000000971398  hitchhiker  0.0000000993182 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0729  50S ribosomal protein L14  43.62 
 
 		 122 aa  96.3  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0102983  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03161  50S ribosomal protein L14  44.67 
 
 		 123 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000022346  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0403  ribosomal protein L14  44.67 
 
 		 123 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000277059  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3793  50S ribosomal protein L14  44.67 
 
 		 123 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000402045  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0235  50S ribosomal protein L14  42.95 
 
 		 122 aa  95.5  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0403  50S ribosomal protein L14  44.67 
 
 		 123 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000132736  hitchhiker  0.0000717726 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0404  50S ribosomal protein L14  43.62 
 
 		 121 aa  95.9  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0379  50S ribosomal protein L14  43.62 
 
 		 121 aa  95.9  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4633  50S ribosomal protein L14  44.67 
 
 		 123 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000683604  normal  0.378647 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03112  hypothetical protein  44.67 
 
 		 123 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000201498  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0943  50S ribosomal protein L14  41.61 
 
 		 122 aa  95.9  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00200525  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3504  50S ribosomal protein L14  44.67 
 
 		 123 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000579404  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3605  50S ribosomal protein L14  44.67 
 
 		 123 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000364384  normal  0.0248646 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2746  50S ribosomal protein L14  44.3 
 
 		 122 aa  95.5  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.014298  normal  0.185382 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3318  50S ribosomal protein L14  41.61 
 
 		 122 aa  95.9  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000362831 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0504  50S ribosomal protein L14  42.95 
 
 		 122 aa  95.9  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0466171  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3695  50S ribosomal protein L14  44.67 
 
 		 123 aa  95.9  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000688942  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2764  ribosomal protein L14  42.95 
 
 		 122 aa  95.1  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000816669  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1943  50S ribosomal protein L14  40.94 
 
 		 122 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2028  50S ribosomal protein L14  40.94 
 
 		 122 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.479722  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0343  50S ribosomal protein L14  43.62 
 
 		 122 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.867842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1936  50S ribosomal protein L14  40.94 
 
 		 122 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0612  ribosomal protein L14  44.37 
 
 		 122 aa  94.7  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3328  ribosomal protein L14  43.62 
 
 		 122 aa  95.1  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000964027  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2164  50S ribosomal protein L14  44 
 
 		 123 aa  95.1  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000108066  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1023  50S ribosomal protein L14  44.37 
 
 		 122 aa  95.1  3e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000448191  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3626  50S ribosomal protein L14  44 
 
 		 123 aa  94.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000411381  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001732  LSU ribosomal protein L14p (L23e)  42.67 
 
 		 123 aa  94.7  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000162129  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0387  50S ribosomal protein L14  43.62 
 
 		 122 aa  94.7  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3991  50S ribosomal protein L14  44 
 
 		 123 aa  94.4  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000125728  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3734  50S ribosomal protein L14  44 
 
 		 123 aa  94.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000182354  normal  0.0166061 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1157  50S ribosomal protein L14  43.62 
 
 		 122 aa  94.7  4e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000242417  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0209  50S ribosomal protein L14  42.95 
 
 		 122 aa  94.7  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000783704  hitchhiker  0.0000000013297 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0044  50S ribosomal protein L14  44.37 
 
 		 122 aa  94.7  4e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.28524  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0597  ribosomal protein L14  42.95 
 
 		 122 aa  94.7  4e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>