22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1267 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_1267  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  301  2.0000000000000002e-81  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1388  hypothetical protein  98.67 
 
 
150 aa  301  3.0000000000000004e-81  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0474  hypothetical protein  97.33 
 
 
150 aa  296  7e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.647005  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0505  conserved hypothetical protein, RDD family  49.32 
 
 
152 aa  154  3e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0950  RDD protein  40.27 
 
 
150 aa  130  6e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0425  RDD protein  42.95 
 
 
149 aa  121  3e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0491  RDD family protein  36.49 
 
 
149 aa  120  6e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.628984  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1260  RDD protein  41.61 
 
 
151 aa  120  8e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0598  RDD domain containing protein  37.67 
 
 
151 aa  106  9.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0234  RDD protein  33.57 
 
 
141 aa  88.2  4e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3078  hypothetical protein  31.58 
 
 
406 aa  57.4  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0628  hypothetical protein  28.47 
 
 
154 aa  52  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0572979  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3024  branched-chain amino acid aminotransferase I  25.97 
 
 
167 aa  47  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0542  RDD family protein  31.43 
 
 
216 aa  46.6  0.0001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0712  RDD domain-containing protein  30.43 
 
 
634 aa  45.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0643  RDD family protein  32.35 
 
 
195 aa  42.7  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0396  RDD  30.67 
 
 
196 aa  42.7  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.476249  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0399  RDD domain-containing protein  31.46 
 
 
278 aa  42  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0177068 
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  24.49 
 
 
166 aa  42  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07960  predicted membrane protein/domain  23.71 
 
 
221 aa  40.4  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.140076  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  26.53 
 
 
257 aa  40  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  24.14 
 
 
169 aa  40  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.846019 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>