28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1047 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1172  transformation system protein  100 
 
 
191 aa  386  1e-107  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.363092  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1047  transformation system protein  100 
 
 
191 aa  386  1e-107  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.733048  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0760  transformation system protein  97.91 
 
 
191 aa  380  1e-105  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00157325  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1143  conserved hypothetical protein, possible purine/pyrimidine phosphoribosyltransferase  61.05 
 
 
190 aa  233  2.0000000000000002e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1469  transformation system protein  52.11 
 
 
189 aa  201  6e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1458  transformation system protein  51.58 
 
 
189 aa  196  1.0000000000000001e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.476694  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0860  hypothetical protein  51.58 
 
 
189 aa  172  2.9999999999999996e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.535933  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1215  transformation system protein  41.63 
 
 
233 aa  165  2.9999999999999998e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1638  transformation system protein  44.5 
 
 
191 aa  154  8e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0309  hypothetical protein  42.11 
 
 
190 aa  143  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1208  phosphoribosyltransferase  26.67 
 
 
202 aa  52  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195663  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1247  phosphoribosyltransferase  26.67 
 
 
202 aa  52  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1385  hypothetical protein  24.27 
 
 
204 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653561  normal  0.716012 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1369  hypothetical protein  24.27 
 
 
204 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1351  hypothetical protein  24.27 
 
 
204 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.163602  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1079  hypothetical protein  22.51 
 
 
222 aa  48.1  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2240  phosphoribosyltransferase  25.17 
 
 
230 aa  46.6  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  22.22 
 
 
233 aa  45.1  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0565  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
181 aa  44.7  0.0008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00922313 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13271  hypothetical protein  24.49 
 
 
213 aa  43.5  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.999438  normal  0.247465 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  24.71 
 
 
244 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20620  predicted amidophosphoribosyltransferase  47.5 
 
 
253 aa  43.5  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.235414  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  25.53 
 
 
234 aa  42.7  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  25.53 
 
 
234 aa  43.1  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  21.29 
 
 
242 aa  42.4  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15330  predicted amidophosphoribosyltransferase  23.96 
 
 
230 aa  42.4  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0698628  normal  0.0235577 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0875  hypothetical protein  22.93 
 
 
255 aa  42  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.656742  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2296  hypothetical protein  23.02 
 
 
241 aa  42  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.658532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>