18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3719 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3719  TPR domain-containing protein  100 
 
 		 213 aa  425  1e-118  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5634  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.56 
 
 		 231 aa  150  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00113498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3815  Tetratricopeptide domain protein  44.68 
 
 		 233 aa  150  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.165621  normal  0.472906 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0496  hypothetical protein  34.98 
 
 		 208 aa  136  2e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5454  Tetratricopeptide domain protein  39.9 
 
 		 237 aa  134  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.525083 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0533  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.8 
 
 		 223 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000139229 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0213  TPR repeat-containing protein  42.5 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09778  hypothetical protein  42.14 
 
 		 257 aa  95.5  6e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.685186  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0326  TPR repeat-containing protein  32.12 
 
 		 262 aa  95.1  6e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1430  TPR domain-containing protein  33.85 
 
 		 228 aa  86.3  3e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.480041 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1798  Tetratricopeptide domain protein  29.17 
 
 		 235 aa  72  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1348  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0705  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2069  TPR repeat  27.92 
 
 		 230 aa  52.4  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2078  TPR domain-containing protein  27.59 
 
 		 242 aa  45.4  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0727  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1366 aa  43.5  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.989916 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0480  TPR repeat-containing protein  24.19 
 
 		 230 aa  41.6  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1777  Tetratricopeptide domain protein  23.2 
 
 		 228 aa  41.6  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>