20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1970 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1970  hypothetical protein  100 
 
 
457 aa  939    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.231871 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2060  hypothetical protein  34.5 
 
 
450 aa  208  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.895563  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4630  hypothetical protein  32.42 
 
 
419 aa  195  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2382  hypothetical protein  32.1 
 
 
439 aa  182  9.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.238732 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1099  hypothetical protein  31.53 
 
 
464 aa  180  4e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5403  hypothetical protein  42.36 
 
 
519 aa  123  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0921  hypothetical protein  24.15 
 
 
381 aa  80.1  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.682885  normal  0.0926038 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2312  hypothetical protein  22.37 
 
 
435 aa  76.3  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.414585 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0639  hypothetical protein  23.89 
 
 
400 aa  64.3  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03863  hypothetical protein  26.79 
 
 
398 aa  56.6  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2323  hypothetical protein  24.14 
 
 
481 aa  54.7  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.696472  decreased coverage  0.0026081 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0937  hypothetical protein  22.59 
 
 
564 aa  52  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3313  putative lipoprotein  24.42 
 
 
411 aa  49.7  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.474661  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1989  hypothetical protein  23.99 
 
 
529 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436263  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3094  hypothetical protein  25 
 
 
238 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.573571  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0692  hypothetical protein  23.68 
 
 
553 aa  44.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.850291  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0601  hypothetical protein  23.68 
 
 
561 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3536  putative lipoprotein  24.32 
 
 
406 aa  44.7  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000150558  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0050  hypothetical protein  40.82 
 
 
448 aa  43.9  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00013841  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0463  hypothetical protein  44.44 
 
 
451 aa  43.9  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000505363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>