More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1059 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1059  GTP cyclohydrolase  100 
 
 		 239 aa  496  1e-140  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.479491 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0468  GTP cyclohydrolase I  66.82 
 
 		 214 aa  322  3e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00942975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1333  GTP cyclohydrolase I  66.03 
 
 		 227 aa  298  4e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00848552 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0955  GTP cyclohydrolase  65.09 
 
 		 229 aa  296  2e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.14078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1006  GTP cyclohydrolase I  66.67 
 
 		 241 aa  294  1e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.961128  normal  0.53094 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0055  GTP cyclohydrolase I  59.53 
 
 		 223 aa  283  1.0000000000000001e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2270  GTP cyclohydrolase I  59.72 
 
 		 223 aa  283  2.0000000000000002e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.759649  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00785  GTP cyclohydrolase I  60.37 
 
 		 225 aa  281  7.000000000000001e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0558  GTP cyclohydrolase I  53.96 
 
 		 230 aa  214  7e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000481  GTP cyclohydrolase I type 1  53.47 
 
 		 217 aa  210  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582087  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06235  GTP cyclohydrolase I  53.23 
 
 		 217 aa  208  6e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02082  GTP cyclohydrolase I  54.04 
 
 		 222 aa  206  3e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.228252  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1505  GTP cyclohydrolase I  54.04 
 
 		 222 aa  206  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0504949  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2300  GTP cyclohydrolase I  54.04 
 
 		 222 aa  206  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.014502 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0813  GTP cyclohydrolase I  54.04 
 
 		 222 aa  206  3e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2287  GTP cyclohydrolase I  54.04 
 
 		 222 aa  206  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3287  GTP cyclohydrolase I  54.04 
 
 		 222 aa  206  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.655724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2449  GTP cyclohydrolase I  54.04 
 
 		 222 aa  206  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1495  GTP cyclohydrolase I  54.04 
 
 		 222 aa  206  3e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02041  hypothetical protein  54.04 
 
 		 222 aa  206  3e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.205869  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0910  GTP cyclohydrolase I  49.75 
 
 		 218 aa  206  4e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.834078  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3602  GTP cyclohydrolase I  52.76 
 
 		 216 aa  205  6e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0354  GTP cyclohydrolase I  52.76 
 
 		 216 aa  205  6e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.689272 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3775  GTP cyclohydrolase I  52.76 
 
 		 216 aa  205  6e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.86022 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2428  GTP cyclohydrolase I  52.68 
 
 		 222 aa  204  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.821616 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2432  GTP cyclohydrolase I  52.68 
 
 		 222 aa  204  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.363143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2339  GTP cyclohydrolase I  52.68 
 
 		 222 aa  204  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2542  GTP cyclohydrolase I  52.68 
 
 		 222 aa  204  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0154777  normal  0.157886 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2384  GTP cyclohydrolase I  52.68 
 
 		 222 aa  204  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.91593 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2753  GTP cyclohydrolase I  54.04 
 
 		 222 aa  204  8e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00675  GTP cyclohydrolase I  51.01 
 
 		 227 aa  204  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4254  GTP cyclohydrolase I  52.26 
 
 		 216 aa  203  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3286  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 		 227 aa  202  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0458  GTP cyclohydrolase I  51.24 
 
 		 214 aa  202  5e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0467391  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0383  GTP cyclohydrolase I  51.24 
 
 		 216 aa  201  6e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0244609 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0371  GTP cyclohydrolase I  51.24 
 
 		 216 aa  201  6e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0372  GTP cyclohydrolase I  51.24 
 
 		 216 aa  201  6e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0397  GTP cyclohydrolase I  51.24 
 
 		 216 aa  201  6e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000172091 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0380  GTP cyclohydrolase I  52.24 
 
 		 219 aa  201  9e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000683928 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0321  GTP cyclohydrolase I  51.76 
 
 		 217 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4566  GTP cyclohydrolase I  50.75 
 
 		 219 aa  199  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000235543 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3162  GTP cyclohydrolase I  52.28 
 
 		 222 aa  198  5e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0322  GTP cyclohydrolase I  51.24 
 
 		 216 aa  198  6e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3834  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 		 216 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3014  GTP cyclohydrolase I  52 
 
 		 220 aa  196  3e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228937 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2405  GTP cyclohydrolase I  52 
 
 		 222 aa  196  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.626916  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2470  GTP cyclohydrolase I  52 
 
 		 220 aa  196  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2568  GTP cyclohydrolase I  52 
 
 		 220 aa  196  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1560  GTP cyclohydrolase I  52.53 
 
 		 221 aa  195  5.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3842  GTP cyclohydrolase I  50.75 
 
 		 219 aa  194  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3486  GTP cyclohydrolase I  49.25 
 
 		 214 aa  191  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0394  GTP cyclohydrolase I  52.15 
 
 		 220 aa  185  6e-46  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.457978  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1670  GTP cyclohydrolase I  55.5 
 
 		 220 aa  178  4.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.731499  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1941  GTP cyclohydrolase I  55.5 
 
 		 220 aa  178  4.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0853389  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2306  GTP cyclohydrolase I  53.5 
 
 		 222 aa  176  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1933  GTP cyclohydrolase I  49.03 
 
 		 217 aa  159  3e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.669415  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4149  GTP cyclohydrolase I  44.56 
 
 		 210 aa  159  5e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0266568 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1048  GTP cyclohydrolase I  45 
 
 		 187 aa  156  3e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1274  GTP cyclohydrolase I  41.01 
 
 		 185 aa  155  4e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000261815  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1096  GTP cyclohydrolase I  41.01 
 
 		 185 aa  154  8e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00097331  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0553  GTP cyclohydrolase I  47.43 
 
 		 188 aa  152  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6956  GTP cyclohydrolase I  40 
 
 		 195 aa  150  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.837765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0193  GTP cyclohydrolase I  41.4 
 
 		 220 aa  151  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0408  GTP cyclohydrolase  42.78 
 
 		 185 aa  149  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.503604  normal  0.0142935 
 
 
-
 
NC_004310  BR1075  GTP cyclohydrolase I  42.44 
 
 		 213 aa  148  6e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.76008  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0625  GTP cyclohydrolase I  40.86 
 
 		 193 aa  148  7e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.497078 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08636  GTP cyclohydrolase I  43.09 
 
 		 199 aa  148  7e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2980  GTP cyclohydrolase I  45.78 
 
 		 185 aa  148  8e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000239263  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1116  GTP cyclohydrolase I  46.91 
 
 		 187 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0977  GTP cyclohydrolase I  42.25 
 
 		 207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.901691  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1588  GTP cyclohydrolase I  40.31 
 
 		 223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0594  GTP cyclohydrolase I  43.58 
 
 		 190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1858  GTP cyclohydrolase I  41.75 
 
 		 218 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0754  GTP cyclohydrolase I  38.6 
 
 		 216 aa  146  3e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0976  GTP cyclohydrolase I  38.5 
 
 		 219 aa  146  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.49412  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1041  GTP cyclohydrolase I  40.33 
 
 		 213 aa  145  6e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25698  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0121  GTP cyclohydrolase I  42.7 
 
 		 189 aa  145  8.000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.952569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0811  GTP cyclohydrolase I  41.49 
 
 		 188 aa  144  9e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000676289  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0041  GTP cyclohydrolase I  40.74 
 
 		 194 aa  144  1e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0859  GTP cyclohydrolase I  39.06 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.765891  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0018  GTP cyclohydrolase I  41.18 
 
 		 182 aa  143  2e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00365351  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0859  GTP cyclohydrolase I  41.15 
 
 		 226 aa  142  5e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.323599 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1363  GTP cyclohydrolase I  44.86 
 
 		 188 aa  142  6e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0737822  normal  0.0760374 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1390  GTP cyclohydrolase I  38.71 
 
 		 213 aa  141  7e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0863  GTP cyclohydrolase I  42.62 
 
 		 188 aa  141  8e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1153  GTP cyclohydrolase I  42.62 
 
 		 184 aa  141  8e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3782  GTP cyclohydrolase I  40.76 
 
 		 189 aa  141  9e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0205  GTP cyclohydrolase I  38.38 
 
 		 200 aa  141  9e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.224052 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23690  GTP cyclohydrolase I  41.21 
 
 		 181 aa  141  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0310829  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3350  GTP cyclohydrolase I  38.97 
 
 		 247 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2208  GTP cyclohydrolase  41.95 
 
 		 199 aa  140  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0579312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0466  GTP cyclohydrolase I  41.3 
 
 		 188 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7173  GTP cyclohydrolase I  40.45 
 
 		 219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.418482  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1496  GTP cyclohydrolase I  40.98 
 
 		 190 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1758  GTP cyclohydrolase I  42.05 
 
 		 187 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11630  GTP cyclohydrolase I  40.98 
 
 		 198 aa  140  3e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1435  GTP cyclohydrolase I  40.22 
 
 		 189 aa  139  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0775791  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2117  GTP cyclohydrolase I  40.84 
 
 		 203 aa  139  3e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6320  GTP cyclohydrolase I  39.33 
 
 		 219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0252905  hitchhiker  0.00245431 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2086  GTP cyclohydrolase I  42.29 
 
 		 179 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>