40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0499 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0499  hypothetical protein  100 
 
 
357 aa  730    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0768136  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6984  protein of unknown function DUF450  57.63 
 
 
362 aa  417  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00893267  hitchhiker  0.0000001532 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1227  hypothetical protein  53.95 
 
 
356 aa  398  9.999999999999999e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.888396  normal  0.616229 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5317  protein of unknown function DUF450  54.77 
 
 
364 aa  388  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0984182  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3124  protein of unknown function DUF450  53.07 
 
 
363 aa  383  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579922  normal  0.419432 
 
 
-
 
NC_002950  PG1591  hypothetical protein  54.12 
 
 
365 aa  379  1e-104  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.330641 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1853  hypothetical protein  50 
 
 
356 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1839  hypothetical protein  50 
 
 
356 aa  355  5e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00358423  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1887  hypothetical protein  50 
 
 
356 aa  355  5e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.132794  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3692  hypothetical protein  49.31 
 
 
362 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.877955 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4039  hypothetical protein  50.42 
 
 
353 aa  349  5e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.400799  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0961  hypothetical protein  48.87 
 
 
354 aa  345  6e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0478229  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1326  hypothetical protein  50.55 
 
 
361 aa  344  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1111  hypothetical protein  49.3 
 
 
357 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03510  prophage Lp2 protein 6  48.34 
 
 
426 aa  333  3e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2922  protein of unknown function DUF450  47.77 
 
 
374 aa  330  3e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4924  hypothetical protein  47.49 
 
 
361 aa  322  5e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3528  protein of unknown function DUF450  43.84 
 
 
375 aa  311  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0402721  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3350  protein of unknown function DUF450  44.48 
 
 
363 aa  304  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3617  hypothetical protein  44.75 
 
 
363 aa  303  4.0000000000000003e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1269  protein of unknown function DUF450  45.61 
 
 
356 aa  302  5.000000000000001e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0165219  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4251  protein of unknown function DUF450  44.66 
 
 
378 aa  301  9e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0242  protein of unknown function DUF450  41.73 
 
 
370 aa  300  2e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3005  hypothetical protein  42.03 
 
 
351 aa  262  8e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.826636  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3361  putative restriction endonuclease or methylase  40.06 
 
 
355 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0837  conserved hypothetical protein (DUF450 domain protein)  39.77 
 
 
347 aa  240  2.9999999999999997e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000053845  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0250  hypothetical protein  40.85 
 
 
380 aa  229  4e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.178621  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0709  hypothetical protein  34.86 
 
 
382 aa  207  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0657  prophage Lp2 protein 6  45.59 
 
 
245 aa  188  1e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0839  hypothetical protein  37.36 
 
 
281 aa  177  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51863  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0309  hypothetical protein  29.14 
 
 
395 aa  162  9e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4887  hypothetical protein  33.21 
 
 
387 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.180443  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0879  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  32.34 
 
 
394 aa  122  9.999999999999999e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000202052  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0842  hypothetical protein  55.84 
 
 
85 aa  88.2  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0515  protein of unknown function DUF450  30.21 
 
 
360 aa  85.9  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0510  hypothetical protein  36.29 
 
 
349 aa  80.1  0.00000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0986  hypothetical protein  29.1 
 
 
372 aa  58.5  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.432153  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2571  protein of unknown function DUF450  23.33 
 
 
268 aa  46.6  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.280266  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0215  protein of unknown function DUF450  24.6 
 
 
207 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0207783  hitchhiker  0.00936489 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0218  protein of unknown function DUF450  24.6 
 
 
207 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>