More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0561 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0561  50S ribosomal protein L19  100 
 
 		 118 aa  232  2.0000000000000002e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.418065  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1034  50S ribosomal protein L19  85.59 
 
 		 118 aa  209  1e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0428583  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0680  50S ribosomal protein L19  82.2 
 
 		 118 aa  202  1e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1429  50S ribosomal protein L19  81.36 
 
 		 118 aa  199  9.999999999999999e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0428647  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1645  ribosomal protein L19  79.66 
 
 		 118 aa  181  3e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0455  50S ribosomal protein L19  71.19 
 
 		 119 aa  180  7e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0814  50S ribosomal protein L19  83.9 
 
 		 118 aa  179  8.000000000000001e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.12275  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0737  50S ribosomal protein L19  83.05 
 
 		 118 aa  179  1e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.400935  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1292  50S ribosomal protein L19  83.05 
 
 		 118 aa  179  1e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0992  50S ribosomal protein L19  82.2 
 
 		 118 aa  177  5.999999999999999e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.656221  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2899  50S ribosomal protein L19  57.89 
 
 		 132 aa  132  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4426  50S ribosomal protein L19  56.25 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3445  50S ribosomal protein L19  55.75 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.549139  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2663  50S ribosomal protein L19  55.17 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3396  50S ribosomal protein L19  55.36 
 
 		 131 aa  130  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.2335 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1325  50S ribosomal protein L19  56.52 
 
 		 116 aa  129  9e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150512  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1300  50S ribosomal protein L19  56.52 
 
 		 116 aa  129  9e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000348159  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0807  50S ribosomal protein L19  54.78 
 
 		 116 aa  129  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000000011018  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0956  50S ribosomal protein L19  54.46 
 
 		 132 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal  0.670119 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1800  50S ribosomal protein L19  59.13 
 
 		 115 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0132543  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3426  50S ribosomal protein L19  55.45 
 
 		 118 aa  128  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3488  50S ribosomal protein L19  55.45 
 
 		 118 aa  128  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5511499999999998e-20 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2107  50S ribosomal protein L19  53.51 
 
 		 148 aa  127  4.0000000000000003e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00250382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4734  50S ribosomal protein L19  53.57 
 
 		 134 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5201  50S ribosomal protein L19  53.57 
 
 		 134 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5273  50S ribosomal protein L19  54.46 
 
 		 130 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.987122 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0648  50S ribosomal protein L19  54.55 
 
 		 118 aa  127  6e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2866  50S ribosomal protein L19  55.45 
 
 		 118 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000321036  hitchhiker  0.000000487764 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2719  50S ribosomal protein L19  55.26 
 
 		 125 aa  127  7.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.877086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0217  50S ribosomal protein L19  58.33 
 
 		 131 aa  127  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4210  50S ribosomal protein L19  53.1 
 
 		 180 aa  126  9.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.425838  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1557  50S ribosomal protein L19  54.63 
 
 		 121 aa  126  9.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.940156  normal  0.0562207 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3101  50S ribosomal protein L19  52.21 
 
 		 177 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.255374  normal  0.735203 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0666  50S ribosomal protein L19  55.36 
 
 		 114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2536  ribosomal protein L19  52.17 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123548  normal  0.284207 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0638  50S ribosomal protein L19  53.15 
 
 		 145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.056681 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4078  50S ribosomal protein L19  52.21 
 
 		 184 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  54.46 
 
 		 113 aa  124  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2510  ribosomal protein L19  51.35 
 
 		 140 aa  124  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0765  50S ribosomal protein L19  55.96 
 
 		 114 aa  124  5e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000038778  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0507  50S ribosomal protein L19  54.46 
 
 		 116 aa  124  5e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1031  ribosomal protein L19  52.14 
 
 		 124 aa  124  5e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.980143  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3755  50S ribosomal protein L19  51.33 
 
 		 183 aa  124  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.649636  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1474  ribosomal protein L19  52.21 
 
 		 121 aa  123  7e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0170029 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1149  50S ribosomal protein L19  51.72 
 
 		 128 aa  123  8.000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000797714  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3419  ribosomal protein L19  52.59 
 
 		 116 aa  122  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30141  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1907  50S ribosomal protein L19  53.15 
 
 		 145 aa  122  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371938  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1835  50S ribosomal protein L19  53.15 
 
 		 145 aa  122  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.610841  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1234  50S ribosomal protein L19  59.18 
 
 		 115 aa  122  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000814658  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0742  50S ribosomal protein L19  52.34 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1221  50S ribosomal protein L19  59.18 
 
 		 115 aa  122  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000033527  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11090  LSU ribosomal protein L19P  53.21 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.168446  normal  0.0967881 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  51.3 
 
 		 114 aa  122  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0341  50S ribosomal protein L19  51.33 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2185  50S ribosomal protein L19  58 
 
 		 114 aa  122  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0675384  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1630  ribosomal protein L19  54.13 
 
 		 113 aa  122  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3663  50S ribosomal protein L19  57 
 
 		 114 aa  122  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000597471  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  48.28 
 
 		 116 aa  121  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0946  50S ribosomal protein L19  52.25 
 
 		 145 aa  121  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0972  50S ribosomal protein L19  54.29 
 
 		 128 aa  121  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000207565  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1171  ribosomal protein L19  55 
 
 		 117 aa  121  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0190  50S ribosomal protein L19  55.45 
 
 		 133 aa  121  4e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0228  ribosomal protein L19  52.68 
 
 		 119 aa  121  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1413  ribosomal protein L19  57.58 
 
 		 119 aa  121  4e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000153602  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5922  ribosomal protein L19  55.14 
 
 		 119 aa  120  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0433266  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2219  50S ribosomal protein L19  51.79 
 
 		 115 aa  120  6e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.43443e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5090  50S ribosomal protein L19  59.6 
 
 		 120 aa  120  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000290678  normal  0.249753 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  52.21 
 
 		 114 aa  120  8e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000423852  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  54.08 
 
 		 118 aa  120  8e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4003  ribosomal protein L19  52.78 
 
 		 118 aa  120  9e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3882  50S ribosomal protein L19  56 
 
 		 114 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000143455  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0544  50S ribosomal protein L19  49.14 
 
 		 115 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000438423  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3691  50S ribosomal protein L19  56 
 
 		 114 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3581  50S ribosomal protein L19  56 
 
 		 114 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.43871e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3599  50S ribosomal protein L19  56 
 
 		 114 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000284782  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1305  50S ribosomal protein L19  56 
 
 		 114 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000891936  unclonable  6.6564e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  56 
 
 		 114 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.655990000000001e-63 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2257  50S ribosomal protein L19  51.3 
 
 		 115 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00054587  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3758  50S ribosomal protein L19  54.55 
 
 		 118 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000121347  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3978  50S ribosomal protein L19  56 
 
 		 114 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000147607  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0087  50S ribosomal protein L19  52.21 
 
 		 146 aa  119  9.999999999999999e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1632  50S ribosomal protein L19  50.44 
 
 		 115 aa  119  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000160789  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3887  50S ribosomal protein L19  56 
 
 		 114 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1198  50S ribosomal protein L19  53.7 
 
 		 118 aa  119  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.633617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1366  ribosomal protein L19  53.92 
 
 		 114 aa  119  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3938  50S ribosomal protein L19  56 
 
 		 114 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000138289  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0549  50S ribosomal protein L19  50.44 
 
 		 115 aa  119  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  8.959370000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0661  50S ribosomal protein L19  50.45 
 
 		 115 aa  119  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126623  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1024  50S ribosomal protein L19  52.21 
 
 		 121 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.688153  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1476  ribosomal protein L19  50.43 
 
 		 116 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0735287  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1309  50S ribosomal protein L19  52.78 
 
 		 118 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1285  50S ribosomal protein L19  50.43 
 
 		 116 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1422  ribosomal protein L19  50.88 
 
 		 130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.420592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2150  50S ribosomal protein L19  57.73 
 
 		 124 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109584  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0739  ribosomal protein L19  54.55 
 
 		 141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000570973 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0989  ribosomal protein L19  54.46 
 
 		 118 aa  119  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000000485147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1144  50S ribosomal protein L19  49.14 
 
 		 115 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000366814  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3002  50S ribosomal protein L19  53.57 
 
 		 115 aa  118  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00296936  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3044  50S ribosomal protein L19  53.57 
 
 		 115 aa  118  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00272781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3132  ribosomal protein L19  54.63 
 
 		 116 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000124659  normal  0.100655 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>