115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0454 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0454  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000558328  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1452  tRNA-Gln  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2162  tRNA-Gln  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.133537  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2251  tRNA-Gln  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0027  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000292778  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0048  tRNA-Gln  92 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.181876  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1723  tRNA-Gln  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1099  tRNA-Gln  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000225043  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0605  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0005  tRNA-Gln  88.71 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000119132  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3564  tRNA-Gln  88.52 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.570193  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3565  tRNA-Gln  88.52 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0013  tRNA-Gln  90.2 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.909375  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0070  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000111082  normal  0.043537 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0072  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000124926  normal  0.0423905 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0074  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000739317  normal  0.0440793 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0049  tRNA-Gln  87.1 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.859256  hitchhiker  0.000000216539 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0032  tRNA-Gln  88.68 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00000308987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4260  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.09084e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0328  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000157113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0033  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000000894061  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0049  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000150139  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000169355  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.926343  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t1806  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000098323  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2564  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0093  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0638  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000166232  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1386  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000259699  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0106  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0059  tRNA-Gln  85.48 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.436402  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0048  tRNA-Gln  85.48 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.509197 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0004  tRNA-Gln  85.48 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  1.40819e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0419  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0333429  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2234  tRNA-Gln  86.79 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0006  tRNA-Gln  85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.404831 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0028  tRNA-Gln  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000428392  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0029  tRNA-Gln  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000397179  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0032  tRNA-Gln  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000333525  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0017  tRNA-Gln  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0205795  normal  0.59199 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0071  tRNA-Gln  83.1 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.429355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0072  tRNA-Gln  83.1 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.212883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0106  tRNA-Gln  83.1 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000012042  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0030  tRNA-Gln  83.1 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629379  hitchhiker  0.000801713 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0114  tRNA-Gln  83.1 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000001247  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0123  tRNA-Gln  83.1 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00201303  hitchhiker  0.000458839 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0815  tRNA-Gln  86.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  unclonable  0.0000000161826  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5652  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000646012  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5682  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259032  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5689  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000231453  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109466  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000184976  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000158624  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000198835  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0951866  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.75916e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000252021  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262249  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000000616644  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000069751  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000190168  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000964949  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000106014  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000553  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000160535  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0049  tRNA-Gln  83.87 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.0255901 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0036  tRNA-Gln  83.87 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000169223  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0037  tRNA-Gln  83.87 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000166881  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0050  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000077158  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0041  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0074  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0016  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000363551  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0053  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000068806  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0041  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.794543  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0047  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000522107  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0085  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000545364  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0038  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258408  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0048  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000232523  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0089  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0127178  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0099  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157171  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0193  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000238459  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0296  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000266549  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0611  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000107562  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0855  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000488484  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t015  tRNA-Gln  82.86 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000513165  hitchhiker  0.000000000516486 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5655  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000792898  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5669  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000100542  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5717  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00280638  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5727  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000826776  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4766  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000101548  hitchhiker  8.34658e-17 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5047  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000895408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5143  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000037642  normal  0.817541 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0172  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0373789 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0274  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>