16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_R0013 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_R0013  tRNA-Gln  100 
 
 
72 bp  143  6e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.909375  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0815  tRNA-Gln  89.83 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  unclonable  0.0000000161826  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0454  tRNA-Gln  90.2 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000558328  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2162  tRNA-Gln  85.48 
 
 
75 bp  52  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.133537  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2251  tRNA-Gln  85.48 
 
 
75 bp  52  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0027  tRNA-Gln  88 
 
 
75 bp  52  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000292778  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0050  tRNA-Gln  84.72 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.124886  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0069  tRNA-Gln  96.43 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0020  tRNA-Gln  84.72 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00188813 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0049  tRNA-Gln  83.1 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.0255901 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0032  tRNA-Gln  83.1 
 
 
72 bp  46.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00000308987  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1452  tRNA-Gln  86.27 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0049  tRNA-Gln  83.1 
 
 
72 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.859256  hitchhiker  0.000000216539 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000845148  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0039  tRNA-Trp  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.319425  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1220  tRNA-Trp  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.28673  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>