42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1829 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1829  ribonuclease P protein component  100 
 
 
80 aa  160  6e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0552  ribonuclease P protein component  63.75 
 
 
81 aa  105  2e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1621  hypothetical protein  75.41 
 
 
61 aa  96.3  1e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0552  ribonuclease P protein component  56.25 
 
 
110 aa  96.3  1e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0821  ribonuclease P protein component  60 
 
 
108 aa  94  6e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0983  ribonuclease P protein component  58.75 
 
 
108 aa  93.6  8e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.162194  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1040  ribonuclease P protein component  60 
 
 
108 aa  92.8  1e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0513155  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0650  ribonuclease P protein component (RNaseP protein) (RNaseP protein) (protein C5)  39.13 
 
 
69 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.963199  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0522  ribonuclease P protein  44.93 
 
 
79 aa  61.2  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  39.44 
 
 
116 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  40.85 
 
 
121 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  43.75 
 
 
117 aa  54.7  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  35.94 
 
 
111 aa  51.2  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  35.29 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  33.82 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  33.82 
 
 
115 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  33.82 
 
 
119 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  33.82 
 
 
115 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  35.29 
 
 
115 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  33.82 
 
 
119 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  33.82 
 
 
119 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  33.82 
 
 
119 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  33.82 
 
 
119 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  33.82 
 
 
115 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  34.57 
 
 
111 aa  47.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3490  ribonuclease P  36.62 
 
 
121 aa  45.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  32.1 
 
 
109 aa  44.7  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1542  ribonuclease P protein component  35 
 
 
162 aa  44.7  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.200332  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  37.1 
 
 
116 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  34.25 
 
 
119 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3615  ribonuclease P protein component  29.27 
 
 
106 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2673  ribonuclease P  36.23 
 
 
125 aa  42  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00724132  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2996  ribonuclease P  36.23 
 
 
125 aa  42  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000822394  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3123  ribonuclease P protein component  34.33 
 
 
108 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000000870513  hitchhiker  0.0000000610775 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0093  ribonuclease P protein component  37.5 
 
 
109 aa  41.6  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5788  ribonuclease P  31.88 
 
 
118 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534341  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0007  ribonuclease P  31.88 
 
 
118 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0873597  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 
116 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5412  ribonuclease P  31.88 
 
 
118 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03486  ribonuclease P protein component  32.43 
 
 
109 aa  40.4  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  41.54 
 
 
120 aa  40.4  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>