More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0116 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1142  cysteinyl-tRNA synthetase  73.32 
 
 		 460 aa  714    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0116  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 464 aa  959    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0579  cysteinyl-tRNA synthetase  64.73 
 
 		 468 aa  629  1e-179  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.717653  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0788  cysteinyl-tRNA synthetase  63.77 
 
 		 459 aa  620  1e-176  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0413015  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0630  cysteinyl-tRNA synthetase  57.94 
 
 		 460 aa  550  1e-155  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.347477  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1054  cysteinyl-tRNA synthetase  58.28 
 
 		 466 aa  551  1e-155  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0823  cysteinyl-tRNA synthetase  56.48 
 
 		 462 aa  533  1e-150  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.449834  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0893  cysteinyl-tRNA synthetase  56.48 
 
 		 462 aa  533  1e-150  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1208  cysteinyl-tRNA synthetase  56.69 
 
 		 462 aa  533  1e-150  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1212  cysteinyl-tRNA synthetase  54.08 
 
 		 466 aa  505  9.999999999999999e-143  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0872595  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 		 456 aa  347  3e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 		 460 aa  345  1e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  38.11 
 
 		 485 aa  344  2e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2398  cysteinyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 461 aa  342  5.999999999999999e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2665  cysteinyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 		 468 aa  342  9e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 		 485 aa  342  1e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  37.98 
 
 		 459 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  37.98 
 
 		 459 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  37.98 
 
 		 459 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  37.96 
 
 		 487 aa  340  4e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  38.38 
 
 		 461 aa  339  5e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 		 494 aa  339  7e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  38.17 
 
 		 461 aa  338  9e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 		 480 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  36.23 
 
 		 481 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  36.53 
 
 		 479 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 		 485 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 		 480 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  37.77 
 
 		 459 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 		 456 aa  335  7.999999999999999e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  37.9 
 
 		 460 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  37.39 
 
 		 459 aa  335  1e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  37.17 
 
 		 493 aa  335  1e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  37.77 
 
 		 459 aa  334  2e-90  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1881  cysteinyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 		 464 aa  333  3e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2249  cysteine--tRNA ligase  38.46 
 
 		 485 aa  333  4e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000746597  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  36.16 
 
 		 493 aa  332  6e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1084  cysteinyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 		 454 aa  332  9e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.462524  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1248  cysteinyl-tRNA synthetase  37.82 
 
 		 461 aa  331  1e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000407868  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0980  cysteinyl-tRNA synthetase  38.25 
 
 		 465 aa  330  2e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  38.09 
 
 		 456 aa  330  2e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  37.34 
 
 		 461 aa  331  2e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  39.74 
 
 		 485 aa  331  2e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  37.18 
 
 		 461 aa  331  2e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  38.03 
 
 		 459 aa  330  2e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00476  cysteinyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 461 aa  330  4e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0063567  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0448  cysteinyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 461 aa  330  4e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000245002  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00481  hypothetical protein  38.89 
 
 		 461 aa  330  4e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114278  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0590  cysteinyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 461 aa  330  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00144184  normal  0.0627987 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0571  cysteinyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 461 aa  330  4e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000388833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4529  cysteinyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 		 462 aa  330  4e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0386515 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 461 aa  330  4e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  36.97 
 
 		 461 aa  330  4e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0582  cysteinyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 461 aa  330  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.193345 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0585  cysteinyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 461 aa  330  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0307581  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3096  cysteinyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 461 aa  330  4e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0232678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0645  cysteinyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 461 aa  330  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.108038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  36.97 
 
 		 461 aa  330  4e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0601  cysteinyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 461 aa  330  4e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000694006  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3087  cysteinyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 461 aa  330  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869328  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  38.57 
 
 		 485 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  36.91 
 
 		 459 aa  329  5.0000000000000004e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  37.84 
 
 		 466 aa  329  7e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0627  cysteinyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 461 aa  329  8e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0130875  normal  0.589324 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2660  cysteinyl-tRNA synthetase  37.82 
 
 		 461 aa  328  8e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0958679  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 		 459 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0583  cysteinyl-tRNA synthetase  39.1 
 
 		 461 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000237473  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 460 aa  327  3e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  36.75 
 
 		 461 aa  327  4.0000000000000003e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  37.78 
 
 		 490 aa  327  4.0000000000000003e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 		 466 aa  326  5e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  37.26 
 
 		 459 aa  326  7e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 		 461 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1645  cysteinyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 		 472 aa  325  1e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0256229  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  35.09 
 
 		 481 aa  325  1e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 		 468 aa  325  1e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 		 461 aa  325  1e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  36.91 
 
 		 461 aa  325  1e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2110  cysteinyl-tRNA synthetase  38.57 
 
 		 460 aa  325  1e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000230638 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 465 aa  324  2e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  36.91 
 
 		 459 aa  325  2e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  38.99 
 
 		 485 aa  323  5e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 		 458 aa  322  6e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 		 460 aa  322  6e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1940  cysteinyl-tRNA synthetase  36.6 
 
 		 462 aa  322  7e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  36.7 
 
 		 459 aa  322  8e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3653  cysteinyl-tRNA synthetase  36.58 
 
 		 465 aa  322  9.999999999999999e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  36.06 
 
 		 466 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2865  cysteinyl-tRNA synthetase  38.11 
 
 		 462 aa  322  9.999999999999999e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  36.55 
 
 		 466 aa  322  9.999999999999999e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0552  cysteinyl-tRNA synthetase  36.55 
 
 		 466 aa  322  9.999999999999999e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0419  cysteinyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 		 453 aa  320  1.9999999999999998e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0310723 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 		 460 aa  321  1.9999999999999998e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  37.6 
 
 		 470 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0149  cysteinyl-tRNA synthetase  37.74 
 
 		 457 aa  320  3e-86  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  38.67 
 
 		 466 aa  320  3e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2893  cysteinyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 		 463 aa  319  5e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.751187  normal  0.0110862 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1102  cysteinyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 		 463 aa  319  6e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  37.26 
 
 		 459 aa  319  7e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  38.72 
 
 		 455 aa  318  9e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>