41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03705 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_03705  DesA1  100 
 
 
333 aa  696    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0968  Acyl-(acyl-carrier-protein) desaturase  71.82 
 
 
330 aa  511  1e-144  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4583  Acyl-(acyl-carrier-protein) desaturase  58.41 
 
 
325 aa  414  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.489587  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5690  Acyl-(acyl-carrier-protein) desaturase  55.49 
 
 
329 aa  399  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1163  Acyl-(acyl-carrier-protein) desaturase  57.14 
 
 
326 aa  388  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.100764  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9316  predicted protein  48.07 
 
 
308 aa  288  8e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15111  predicted protein  44.2 
 
 
329 aa  275  6e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.430971  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3578  fatty acid desaturase type 2  28.52 
 
 
316 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.327469  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0307  fatty acid desaturase, type 2  27.82 
 
 
312 aa  106  7e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1903  hypothetical protein  27.48 
 
 
310 aa  106  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6505  fatty acid desaturase type 2  27.97 
 
 
318 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478393  normal  0.21455 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10839  acyl-[acyl-carrier protein] desaturase desA1  26.23 
 
 
338 aa  99.4  8e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.8850299999999998e-27  hitchhiker  0.0000114549 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1811  fatty acid desaturase type 2  26.13 
 
 
311 aa  95.1  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.156442  hitchhiker  0.0000155427 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4598  fatty acid desaturase, type 2  25.15 
 
 
331 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4511  fatty acid desaturase, type 2  25.15 
 
 
331 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1820  fatty acid desaturase, type 2  25.39 
 
 
311 aa  94  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0523547  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4894  fatty acid desaturase, type 2  25.15 
 
 
331 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.688927 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5927  fatty acid desaturase, type 2  26.87 
 
 
307 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4940  fatty acid desaturase, type 2  26.18 
 
 
335 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5028  fatty acid desaturase, type 2  26.18 
 
 
335 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5321  fatty acid desaturase, type 2  26.18 
 
 
335 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4144  fatty acid desaturase type 2  25 
 
 
333 aa  87.8  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2173  fatty acid desaturase type 2  29.03 
 
 
329 aa  87  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0992  fatty acid desaturase type 2  26.35 
 
 
321 aa  85.9  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1668  fatty acid desaturase, type 2  24.92 
 
 
335 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3918  fatty acid desaturase type 2  22.87 
 
 
330 aa  84  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5085  fatty acid desaturase, type 2  25.78 
 
 
335 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1946  fatty acid desaturase type 2  23.49 
 
 
324 aa  80.5  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.323974  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3535  fatty acid desaturase type 2  23.33 
 
 
329 aa  75.9  0.0000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2162  putative acyl-[acyl-carrier protein] desaturase  26.64 
 
 
302 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2881  acyl-[acyl-carrier protein] desaturase  25.7 
 
 
310 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1064  fatty acid desaturase type 2  26.17 
 
 
302 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.183632  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3536  fatty acid desaturase type 2  22.64 
 
 
334 aa  73.2  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2141  fatty acid desaturase type 2  23.96 
 
 
331 aa  68.9  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130014  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0121  fatty acid desaturase, type 2  24.06 
 
 
364 aa  62.4  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00366287  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11115  acyl-[acyl-carrier protein] desaturase desA2  22.58 
 
 
275 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00275756  normal  0.545687 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4205  fatty acid desaturase, type 2  21.51 
 
 
275 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.486224 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4130  fatty acid desaturase, type 2  21.51 
 
 
275 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3129  putative fatty acid desaturase  28.3 
 
 
276 aa  46.2  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.353382  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4653  fatty acid desaturase, type 2  21.03 
 
 
275 aa  44.3  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.424054  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4361  fatty acid desaturase, type 2  21.26 
 
 
275 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.201544 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>