20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03635 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_03635  Uroporphyrinogen-III synthase  100 
 
 
217 aa  444  1.0000000000000001e-124  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.32733  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0945  uroporphyrinogen III synthase HEM4  37.74 
 
 
221 aa  138  7.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.349608  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1477  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.5 
 
 
227 aa  100  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6501  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.56 
 
 
248 aa  87.8  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.429257 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1890  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.73 
 
 
238 aa  67.8  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4554  uroporphyrinogen-III synthase  29.26 
 
 
250 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4207  uroporphyrinogen-III synthase  29.26 
 
 
250 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4550  uroporphyrinogen-III synthase  29.26 
 
 
250 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4599  uroporphyrinogen-III synthase  28.19 
 
 
250 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4308  uroporphyrinogen-III synthase  28.72 
 
 
250 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4695  uroporphyrinogen-III synthase  29.26 
 
 
250 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.870558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4360  uroporphyrinogen-III synthase  29.26 
 
 
250 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.578422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4196  uroporphyrinogen-III synthase  28.72 
 
 
250 aa  52.8  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3179  uroporphyrinogen-III synthase  29.51 
 
 
252 aa  47.8  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1837  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.61 
 
 
247 aa  44.7  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2913  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.48 
 
 
260 aa  42.4  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.195548  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3227  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.58 
 
 
261 aa  42  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0100705  normal  0.638132 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1015  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  28.57 
 
 
577 aa  41.6  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.172682  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2985  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.18 
 
 
234 aa  41.6  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.202243  normal  0.850661 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0169  uroporphyrinogen-III synthase  26.45 
 
 
265 aa  41.6  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.315253 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>