More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00785 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_00785  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 		 225 aa  462  1e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2270  GTP cyclohydrolase I  78.24 
 
 		 223 aa  363  1e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.759649  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0055  GTP cyclohydrolase I  76.89 
 
 		 223 aa  349  2e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1333  GTP cyclohydrolase I  63.81 
 
 		 227 aa  287  1e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00848552 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1006  GTP cyclohydrolase I  61.32 
 
 		 241 aa  286  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.961128  normal  0.53094 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0468  GTP cyclohydrolase I  60.56 
 
 		 214 aa  285  4e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00942975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0955  GTP cyclohydrolase  61.03 
 
 		 229 aa  284  5.999999999999999e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.14078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1059  GTP cyclohydrolase  60.37 
 
 		 239 aa  281  6.000000000000001e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.479491 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000481  GTP cyclohydrolase I type 1  51.43 
 
 		 217 aa  199  3e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582087  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06235  GTP cyclohydrolase I  50.95 
 
 		 217 aa  198  5e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2428  GTP cyclohydrolase I  51.76 
 
 		 222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.821616 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2432  GTP cyclohydrolase I  51.76 
 
 		 222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.363143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2384  GTP cyclohydrolase I  51.76 
 
 		 222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.91593 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2542  GTP cyclohydrolase I  51.76 
 
 		 222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0154777  normal  0.157886 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2339  GTP cyclohydrolase I  51.76 
 
 		 222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02082  GTP cyclohydrolase I  51.26 
 
 		 222 aa  196  3e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.228252  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1505  GTP cyclohydrolase I  51.26 
 
 		 222 aa  196  3e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0504949  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2287  GTP cyclohydrolase I  51.26 
 
 		 222 aa  196  3e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1495  GTP cyclohydrolase I  51.26 
 
 		 222 aa  196  3e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02041  hypothetical protein  51.26 
 
 		 222 aa  196  3e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.205869  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2449  GTP cyclohydrolase I  51.26 
 
 		 222 aa  196  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0813  GTP cyclohydrolase I  51.26 
 
 		 222 aa  196  3e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3287  GTP cyclohydrolase I  51.26 
 
 		 222 aa  196  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.655724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2300  GTP cyclohydrolase I  51.26 
 
 		 222 aa  196  3e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.014502 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2753  GTP cyclohydrolase I  51.26 
 
 		 222 aa  196  3e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00675  GTP cyclohydrolase I  50.77 
 
 		 227 aa  195  5.000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0558  GTP cyclohydrolase I  52.04 
 
 		 230 aa  194  7e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2470  GTP cyclohydrolase I  51.76 
 
 		 220 aa  193  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2568  GTP cyclohydrolase I  51.76 
 
 		 220 aa  193  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3014  GTP cyclohydrolase I  51.76 
 
 		 220 aa  193  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228937 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3162  GTP cyclohydrolase I  52.31 
 
 		 222 aa  192  4e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0910  GTP cyclohydrolase I  47.74 
 
 		 218 aa  190  1e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.834078  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1560  GTP cyclohydrolase I  49.06 
 
 		 221 aa  190  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3286  GTP cyclohydrolase I  51.28 
 
 		 227 aa  190  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2405  GTP cyclohydrolase I  50.25 
 
 		 222 aa  188  7e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.626916  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4566  GTP cyclohydrolase I  49.23 
 
 		 219 aa  179  4e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000235543 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0380  GTP cyclohydrolase I  49.23 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000683928 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0394  GTP cyclohydrolase I  51.96 
 
 		 220 aa  177  2e-43  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.457978  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0321  GTP cyclohydrolase I  50.27 
 
 		 217 aa  176  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3842  GTP cyclohydrolase I  48.72 
 
 		 219 aa  175  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3602  GTP cyclohydrolase I  47.74 
 
 		 216 aa  175  6e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3775  GTP cyclohydrolase I  47.74 
 
 		 216 aa  175  6e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.86022 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0354  GTP cyclohydrolase I  47.74 
 
 		 216 aa  174  7e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.689272 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0458  GTP cyclohydrolase I  47.18 
 
 		 214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0467391  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4254  GTP cyclohydrolase I  47.69 
 
 		 216 aa  172  5e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0397  GTP cyclohydrolase I  47.18 
 
 		 216 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000172091 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0383  GTP cyclohydrolase I  47.18 
 
 		 216 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0244609 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0372  GTP cyclohydrolase I  47.18 
 
 		 216 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0371  GTP cyclohydrolase I  47.18 
 
 		 216 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1941  GTP cyclohydrolase I  50.75 
 
 		 220 aa  171  7.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0853389  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1670  GTP cyclohydrolase I  50.75 
 
 		 220 aa  171  7.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.731499  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3486  GTP cyclohydrolase I  50.28 
 
 		 214 aa  170  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2306  GTP cyclohydrolase I  50.75 
 
 		 222 aa  169  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3834  GTP cyclohydrolase I  48.92 
 
 		 216 aa  169  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0322  GTP cyclohydrolase I  48.72 
 
 		 216 aa  170  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1933  GTP cyclohydrolase I  52.87 
 
 		 217 aa  157  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.669415  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1758  GTP cyclohydrolase I  46.49 
 
 		 187 aa  155  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0553  GTP cyclohydrolase I  48.09 
 
 		 188 aa  154  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12810  GTP cyclohydrolase I  45.98 
 
 		 188 aa  152  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106699  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0977  GTP cyclohydrolase I  46.15 
 
 		 207 aa  151  5.9999999999999996e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.901691  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2980  GTP cyclohydrolase I  47.43 
 
 		 185 aa  151  5.9999999999999996e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000239263  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0811  GTP cyclohydrolase I  45.45 
 
 		 188 aa  151  8.999999999999999e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000676289  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6956  GTP cyclohydrolase I  45.45 
 
 		 195 aa  150  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.837765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01250  GTP cyclohydrolase I  43.96 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4149  GTP cyclohydrolase I  44.02 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0266568 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0193  GTP cyclohydrolase I  44.32 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1048  GTP cyclohydrolase I  45.25 
 
 		 187 aa  150  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0594  GTP cyclohydrolase I  44.44 
 
 		 190 aa  149  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1588  GTP cyclohydrolase I  40.27 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08636  GTP cyclohydrolase I  44.26 
 
 		 199 aa  149  4e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1694  GTP cyclohydrolase I  43.55 
 
 		 195 aa  148  5e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0625  GTP cyclohydrolase I  41.58 
 
 		 193 aa  148  7e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.497078 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1041  GTP cyclohydrolase I  42.94 
 
 		 213 aa  148  8e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25698  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1075  GTP cyclohydrolase I  43.02 
 
 		 213 aa  148  8e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.76008  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1363  GTP cyclohydrolase I  47.78 
 
 		 188 aa  147  9e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0737822  normal  0.0760374 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1496  GTP cyclohydrolase I  43.17 
 
 		 190 aa  147  1.0000000000000001e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1233  GTP cyclohydrolase I  43.65 
 
 		 186 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.520451  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0205  GTP cyclohydrolase I  43.65 
 
 		 200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.224052 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5371  GTP cyclohydrolase I  48.02 
 
 		 202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021481 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0408  GTP cyclohydrolase  42.25 
 
 		 185 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.503604  normal  0.0142935 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1858  GTP cyclohydrolase I  44.74 
 
 		 218 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0560  GTP cyclohydrolase I  47.78 
 
 		 198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0754  GTP cyclohydrolase I  41.46 
 
 		 216 aa  146  3e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1274  GTP cyclohydrolase I  42.69 
 
 		 185 aa  146  3e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000261815  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0859  GTP cyclohydrolase I  43.09 
 
 		 219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.765891  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0018  GTP cyclohydrolase I  44.39 
 
 		 182 aa  145  4.0000000000000006e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00365351  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0628  GTP cyclohydrolase I  44.63 
 
 		 216 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00907576  normal  0.596235 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0703  GTP cyclohydrolase I  40.88 
 
 		 200 aa  145  6e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.659577 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1417  GTP cyclohydrolase I  47.46 
 
 		 202 aa  145  6e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0939042  normal  0.395983 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2103  GTP cyclohydrolase I  44.38 
 
 		 200 aa  145  6e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0315  GTP cyclohydrolase I  45.36 
 
 		 214 aa  145  6e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1096  GTP cyclohydrolase I  42.69 
 
 		 185 aa  145  6e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00097331  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1778  GTP cyclohydrolase I  43.26 
 
 		 190 aa  145  7.0000000000000006e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0121  GTP cyclohydrolase I  44.81 
 
 		 189 aa  144  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.952569  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2035  GTP cyclohydrolase I  43.09 
 
 		 181 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31903  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2894  GTP cyclohydrolase I  43.48 
 
 		 207 aa  144  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5155  GTP cyclohydrolase I  46.33 
 
 		 201 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.780248 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4769  GTP cyclohydrolase I  46.33 
 
 		 201 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0152  GTP cyclohydrolase  45.86 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4855  GTP cyclohydrolase I  46.33 
 
 		 201 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>