26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0449 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0449  putative type IV secretion system protein VirB3/TraD  100 
 
 		 110 aa  219  7e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0162  type IV secretory pathway VirB3 family protein  82.73 
 
 		 110 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2656  putative type IV secretion system protein VirB3/TraD  80.95 
 
 		 106 aa  174  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.556613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6505  type IV secretory pathway VirB3 family protein  77.88 
 
 		 114 aa  174  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1755  putative type IV secretion system protein VirB3/TraD  77.36 
 
 		 106 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.958773 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3314  type IV secretory pathway, VirB3 family protein  72.64 
 
 		 106 aa  159  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4852  type IV secretory pathway, VirB3-like  72.38 
 
 		 112 aa  158  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4201  type IV secretory pathway VirB3 family protein  71.7 
 
 		 106 aa  157  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0067  type IV secretion system protein VirB3  42.16 
 
 		 116 aa  84.7  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00447561  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0061  type IV secretion system protein VirB3  42.16 
 
 		 128 aa  84.7  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6324  type IV secretory pathway VirB3 family protein  40.54 
 
 		 113 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0028  cmgB3/4  36.36 
 
 		 922 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a009  secretion/conjugal transfer ATPase VirB3/4  31.13 
 
 		 924 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0871  type IV secretory pathway VirB3 family protein  33.67 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0108  TriC protein  40 
 
 		 916 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0037  triC protein  32.61 
 
 		 915 aa  51.2  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4347  type IV secretory pathway, VirB3-like  27.52 
 
 		 112 aa  47.8  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2442  type IV secretory pathway VirB3 family protein  33.33 
 
 		 102 aa  47.4  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.79385 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1487  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  32.18 
 
 		 915 aa  45.1  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5087  type IV secretory pathway VirB3 family protein  24.77 
 
 		 112 aa  43.9  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0256  Type IV secretory pathway AvhB3 protein  29.7 
 
 		 112 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.990445 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0676  type IV secretory pathway VirB3 family protein  28.71 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4563  type IV secretory pathway VirB3 family protein  32 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185995  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6406  type IV secretory pathway VirB3 family protein  32 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4178  type IV secretory pathway, VirB3-like  27.18 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7535  type IV secretory pathway VirB3 family protein  33.33 
 
 		 145 aa  40  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.362734  normal  0.0511266 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>