36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3299 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3299  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  255  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.103854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1247  hypothetical protein  90.98 
 
 		 122 aa  230  5e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.670192 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2085  hypothetical protein  72.16 
 
 		 126 aa  153  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.97593  normal  0.098717 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5659  periplasmic protein  57.28 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0980  hypothetical protein  52.85 
 
 		 128 aa  121  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0960  periplasmic protein  50.41 
 
 		 127 aa  120  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0320  hypothetical protein  56.12 
 
 		 142 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0275977  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1920  hypothetical protein  56.12 
 
 		 142 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.367365  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0830  hypothetical protein  56.12 
 
 		 142 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1037  hypothetical protein  56.12 
 
 		 142 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.229002  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1198  hypothetical protein  56.12 
 
 		 128 aa  120  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.276892  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1190  hypothetical protein  56.12 
 
 		 128 aa  120  8e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511323  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1350  hypothetical protein  56.12 
 
 		 128 aa  120  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2340  periplasmic protein  57.28 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0115915 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2317  periplasmic protein  56.31 
 
 		 126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1705  periplasmic protein  56.31 
 
 		 126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2236  periplasmic protein  54.05 
 
 		 127 aa  117  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2356  periplasmic protein  54.05 
 
 		 127 aa  117  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675978  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2215  putative periplasmic protein  36.17 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2878  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  41.57 
 
 		 241 aa  70.9  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2759  conserved hypothetical signal peptide protein  36.67 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.30249 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2356  putative signal peptide protein  40.79 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0606441  normal  0.148323 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0552  hypothetical protein  36.79 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.992206  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2496  putative signal peptide protein  33.33 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.538855 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4650  lysozyme inhibitor  44.93 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53040  lysozyme inhibitor  44.93 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0447  hypothetical protein  41.1 
 
 		 121 aa  51.6  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0440  hypothetical protein  41.1 
 
 		 121 aa  51.6  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.577276  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0084  hypothetical protein  45.1 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.476638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1771  putative lipoprotein  34.55 
 
 		 105 aa  47  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0555699  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2556  putative lipoprotein  34.55 
 
 		 105 aa  47  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0857422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1879  hypothetical protein  36.9 
 
 		 104 aa  47  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116549  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2217  putative lipoprotein  29.82 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000479557 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0036  hypothetical protein  27.88 
 
 		 130 aa  43.9  0.0008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0178  hypothetical protein  30.95 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000306154 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0544  hypothetical protein  30 
 
 		 154 aa  40  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>