33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2592 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2592  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5701  hypothetical protein  72 
 
 		 108 aa  142  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1018  hypothetical protein  69.61 
 
 		 110 aa  135  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0697598  normal  0.0957494 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4587  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  56.84 
 
 		 112 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.918729 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6773  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  56.84 
 
 		 112 aa  106  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00017117  normal  0.0671695 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4222  hypothetical protein  53.68 
 
 		 108 aa  98.2  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.804885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2172  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  51.58 
 
 		 108 aa  97.1  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000970391 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6195  hypothetical protein  60.34 
 
 		 84 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170725  normal  0.0606924 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3892  hypothetical protein  47.69 
 
 		 84 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3930  hypothetical protein  43.94 
 
 		 85 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2777  hypothetical protein  43.94 
 
 		 87 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000199644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1142  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  40.85 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02370  hypothetical protein  37.68 
 
 		 83 aa  57  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.14298  normal  0.0406002 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6763  hypothetical protein  44.12 
 
 		 87 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0430903  normal  0.248334 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6348  hypothetical protein  34.72 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00180642  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5596  nucleoid protein H-NS  35.21 
 
 		 102 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.16143  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4294  hypothetical protein  37.84 
 
 		 89 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4404  hypothetical protein  37.84 
 
 		 89 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4238  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.39 
 
 		 102 aa  50.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4348  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.39 
 
 		 102 aa  50.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.513312 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5064  hypothetical protein  33.8 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02604  putative HNS-like transcription regulator protein  33.8 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00414449  normal  0.0842767 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6383  hypothetical protein  32.5 
 
 		 91 aa  49.7  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.621443  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1172  putative DNA-binding protein H-NS  32.05 
 
 		 122 aa  48.1  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3959  hypothetical protein  32.29 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0572114  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3677  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  32.39 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1370  nucleoid protein H-NS  35 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.620152  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1795  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.49 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2290  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.77 
 
 		 112 aa  43.5  0.0009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4578  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.11 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4462  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  45.71 
 
 		 99 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168905  normal  0.0423453 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4730  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.03 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.167387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1351  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.88 
 
 		 130 aa  40  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0110439  hitchhiker  0.00767889 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>