17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2574 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2574  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  474  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.960669  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1779  hypothetical protein  71.95 
 
 
230 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.080581  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6485  hypothetical protein  67.84 
 
 
230 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.32535  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0238  hypothetical protein  66.09 
 
 
234 aa  292  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0474  hypothetical protein  65.22 
 
 
234 aa  290  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.772079 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4985  hypothetical protein  27.23 
 
 
234 aa  73.2  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322799  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0197  hypothetical protein  30.89 
 
 
302 aa  64.3  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00393973 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2175  mobilization protein MobD-like  26.09 
 
 
234 aa  52.8  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0519268  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2956  putative mobilization protein MobD  24 
 
 
230 aa  48.5  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0030  conjugal transfer protein TraL  26.22 
 
 
242 aa  45.4  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  4.98281e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2492  hypothetical protein  21.86 
 
 
252 aa  44.7  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.276258  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0426  putative mobilization protein MobD  42.86 
 
 
242 aa  44.3  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2341  hypothetical protein  26.59 
 
 
231 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1729  hypothetical protein  26.59 
 
 
231 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3067  transfer origin protein, TraL  25.32 
 
 
271 aa  42.7  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2364  putative mobilization protein MobD  26.59 
 
 
231 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1733  chromosome partitioning ATPase  31.58 
 
 
419 aa  42  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.635765 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>