30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1880 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1880  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  100 
 
 		 151 aa  301  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.987972 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5559  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  76.35 
 
 		 152 aa  222  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0406326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1128  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  61.76 
 
 		 143 aa  159  9e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.348126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0420  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  58.82 
 
 		 151 aa  156  8e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.430144  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0124  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  56.85 
 
 		 151 aa  156  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0148  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  56.85 
 
 		 151 aa  156  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.165586  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2651  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  56.85 
 
 		 151 aa  156  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.793575  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2793  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  56.85 
 
 		 151 aa  156  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.984814  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1291  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  56.85 
 
 		 151 aa  156  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50661  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1055  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  56.85 
 
 		 151 aa  156  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0048  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  59.4 
 
 		 139 aa  154  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0316883 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2774  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  54.96 
 
 		 153 aa  143  8.000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.141891  normal  0.534011 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19680  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  48.92 
 
 		 146 aa  128  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.346073  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1056  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.74 
 
 		 139 aa  103  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4098  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.12 
 
 		 146 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000020928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3930  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.38 
 
 		 146 aa  99.4  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.6522  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1439  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.18 
 
 		 150 aa  94.7  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0436  ATP synthase F1, epsilon subunit  38.71 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2990  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.8 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136742  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35127  F-ATPase family transporter: protons (mitochondrial)  31.52 
 
 		 170 aa  49.3  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1064  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  25.98 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.381379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2335  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.56 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2669  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  25.41 
 
 		 129 aa  46.2  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0468  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.29 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.3605  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3105  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  25.98 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.200708 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0889  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  25 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.191258  normal  0.156893 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2082  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.65 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.929878  normal  0.384385 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4494  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.75 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.023133 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1024  ATP synthase F1, epsilon subunit  24.51 
 
 		 130 aa  40.4  0.007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0216  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.63 
 
 		 141 aa  40.4  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>