16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4717 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4717  putative signal peptide protein  100 
 
 		 217 aa  424  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.525776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3966  putative signal peptide protein  57.01 
 
 		 229 aa  228  7e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.462545  normal  0.0568968 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3952  hypothetical protein  53.18 
 
 		 219 aa  198  3.9999999999999996e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3174  putative signal peptide protein  47.44 
 
 		 228 aa  180  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.56163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3993  sporulation domain-containing protein  42.24 
 
 		 243 aa  160  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.176394 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3342  Sporulation domain protein  41.38 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.796684  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0881  sporulation domain-containing protein  39.29 
 
 		 251 aa  149  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.369909 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4630  sporulation domain-containing protein  43.95 
 
 		 247 aa  144  8.000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.747598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0226  putative signal peptide protein  37.9 
 
 		 219 aa  106  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000356049 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0262  putative signal peptide protein  33.7 
 
 		 235 aa  71.6  0.000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0104  putative signal peptide protein  30.77 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0075  hypothetical protein  29.03 
 
 		 264 aa  58.5  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0310  putative signal peptide protein  30.82 
 
 		 272 aa  57  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5199  sporulation domain-containing protein  47.37 
 
 		 62 aa  51.2  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0693658  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0165  Sporulation domain protein  25.41 
 
 		 261 aa  48.9  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.708881 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0172  Sporulation domain protein  31.3 
 
 		 259 aa  45.4  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>