17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2010 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2010  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  357  4e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.661275  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3009  hypothetical protein  78.74 
 
 		 178 aa  267  7e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.823092  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2519  hypothetical protein  64.32 
 
 		 189 aa  224  8e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0448156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1235  hypothetical protein  64.15 
 
 		 170 aa  205  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.422621 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2071  hypothetical protein  63.35 
 
 		 183 aa  195  3e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.953764  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3010  hypothetical protein  65.17 
 
 		 185 aa  194  5.000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.313991  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1643  hypothetical protein  63.35 
 
 		 183 aa  194  5.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0922744  normal  0.0412546 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2568  hypothetical protein  58.13 
 
 		 164 aa  180  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0024808 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0396  hypothetical protein  59.29 
 
 		 183 aa  144  9e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.222332  normal  0.111519 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3430  hypothetical protein  39.51 
 
 		 157 aa  89.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.784858  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3550  hypothetical protein  39.58 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3635  hypothetical protein  24.85 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3335  hypothetical protein  24.26 
 
 		 163 aa  45.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.122468 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0307  putative tricarboxylic transport membrane protein  27.33 
 
 		 164 aa  45.1  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4256  putative tricarboxylic transport membrane protein  26.52 
 
 		 163 aa  45.1  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.313811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3918  putative tricarboxylic transport membrane protein  24.62 
 
 		 165 aa  41.6  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0635614  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6111  hypothetical protein  28.03 
 
 		 164 aa  41.2  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>