More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7202 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_7202  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 		 128 aa  264  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0603  ferric uptake regulator family protein  45.22 
 
 		 138 aa  118  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.401566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4555  ferric uptake regulator family protein  43.9 
 
 		 145 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3966  ferric uptake regulator family protein  47.83 
 
 		 150 aa  117  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.867334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2737  ferric uptake regulator family protein  51.75 
 
 		 142 aa  115  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.348547  normal  0.830954 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2458  ferric uptake regulator  51.75 
 
 		 142 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3457  ferric uptake regulator  51.75 
 
 		 142 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0616  ferric uptake regulator family protein  51.75 
 
 		 142 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.740565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3455  ferric uptake regulator  51.75 
 
 		 142 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.114286  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0375  ferric uptake regulator  51.75 
 
 		 142 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3420  ferric uptake regulator  51.75 
 
 		 142 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133952  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2645  ferric uptake regulator  51.75 
 
 		 142 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0166  ferric uptake regulator family protein  51.75 
 
 		 142 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1234  ferric uptake regulator  51.75 
 
 		 142 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0649  ferric uptake regulator family protein  51.75 
 
 		 142 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3924  ferric uptake regulator family protein  45.76 
 
 		 149 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3272  ferric uptake regulator, Fur family  45.76 
 
 		 138 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.710175  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2986  ferric uptake regulator, Fur family  50.89 
 
 		 143 aa  114  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.105319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0570  ferric uptake regulator family protein  50.88 
 
 		 142 aa  114  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.233033 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2576  ferric uptake regulator, Fur family  50.89 
 
 		 143 aa  114  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.710249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0544  ferric uptake regulator family protein  50.88 
 
 		 142 aa  114  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0596927  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1206  ferric uptake regulator  50.88 
 
 		 142 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3735  ferric uptake regulator family protein  50.88 
 
 		 142 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.345676 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0406  ferric uptake regulator, Fur family  45.22 
 
 		 139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2747  ferric uptake transcriptional repressor transcription regulator protein  50 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0571  ferric uptake regulator family protein  51.75 
 
 		 142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0223  transcriptional regulator  48.36 
 
 		 145 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2837  ferric uptake regulator family protein  48.67 
 
 		 143 aa  110  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3385  ferric uptake regulator, Fur family  50.88 
 
 		 142 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.514247  hitchhiker  0.0000888993 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0753  ferric uptake regulator family protein  43.31 
 
 		 148 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.629039  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2976  ferric uptake regulator family protein  48.67 
 
 		 143 aa  110  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6009  ferric uptake regulator family protein  44.35 
 
 		 155 aa  110  8.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.964976 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2593  ferric uptake regulator family protein  50.88 
 
 		 142 aa  110  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000283641 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4610  ferric uptake regulator family protein  45.54 
 
 		 181 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3944  ferric uptake regulator, Fur family  45.24 
 
 		 151 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.701643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4057  ferric uptake regulator, Fur family  45.24 
 
 		 151 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5746  ferric uptake regulator, DNA-binding transcriptional dual regulator of siderophore biosynthesis and transport  44.92 
 
 		 157 aa  107  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0247  ferric uptake transcriptional (FUR)-like transcription regulator protein  44.44 
 
 		 151 aa  106  9.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.406535  normal  0.140515 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2623  ferric uptake regulation protein  43.55 
 
 		 143 aa  106  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.376677  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5530  ferric uptake regulator family protein  44.83 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0229  ferric uptake regulator family protein  45.08 
 
 		 151 aa  104  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3791  ferric uptake regulator family protein  44.64 
 
 		 152 aa  103  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3653  ferric uptake regulator family protein  45.54 
 
 		 149 aa  103  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.188238  normal  0.295199 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4234  ferric uptake regulator family protein  41.13 
 
 		 167 aa  103  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0343972  normal  0.519768 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0474  ferric uptake regulator family protein  46.02 
 
 		 143 aa  103  9e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0934  ferric uptake regulator family protein  44.25 
 
 		 147 aa  103  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.634788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1123  ferric uptake regulator family protein  42.86 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.488583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0251  ferric uptake regulator, Fur family  44.26 
 
 		 167 aa  100  6e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1481  ferric uptake regulator family protein  44.35 
 
 		 140 aa  100  8e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.268678  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0438  ferric uptake regulation protein  43.1 
 
 		 136 aa  99  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0414  ferric uptake regulation protein  43.1 
 
 		 136 aa  99  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0458  ferric uptake regulator, Fur family  41.18 
 
 		 158 aa  97.8  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000485327 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0282  ferric uptake regulation protein  41.18 
 
 		 158 aa  97.8  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1727  ferric uptake regulator, Fur family  44.64 
 
 		 146 aa  97.1  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.745172  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0894  ferric uptake regulator family protein  46.43 
 
 		 152 aa  96.7  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572753 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1905  ferric uptake regulator family protein  40.68 
 
 		 140 aa  95.5  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2152  ferric uptake regulator  41.96 
 
 		 140 aa  95.1  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1434  ferric uptake regulator  42.98 
 
 		 161 aa  94  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000031646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  37.72 
 
 		 155 aa  93.6  8e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  37.72 
 
 		 155 aa  93.2  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0849  ferric uptake regulator  42.02 
 
 		 150 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000679753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0752  ferric uptake regulator  42.02 
 
 		 150 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000171486  normal  0.37739 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0813  ferric uptake regulator  42.02 
 
 		 150 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000465454  normal  0.444337 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0475  ferric uptake regulator family protein  42.86 
 
 		 149 aa  92  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0740  ferric uptake regulator  42.02 
 
 		 150 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0800  ferric uptake regulator  39.53 
 
 		 150 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00301514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1661  ferric uptake regulator  41.23 
 
 		 143 aa  92  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000966153  normal  0.373988 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00640  ferric uptake regulator  42.02 
 
 		 148 aa  92  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0211931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2954  ferric uptake regulator, Fur family  42.02 
 
 		 148 aa  92  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000269107  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00631  hypothetical protein  42.02 
 
 		 148 aa  92  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0172811  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1575  ferric uptake regulator  41.96 
 
 		 147 aa  91.7  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0711  ferric uptake regulator  42.02 
 
 		 148 aa  92  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2973  ferric uptake regulator  42.02 
 
 		 148 aa  92  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00611688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01339  ferric uptake regulator  39.84 
 
 		 149 aa  91.7  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0705  ferric uptake regulator  42.02 
 
 		 148 aa  92  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000882448  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  43.93 
 
 		 143 aa  91.7  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0778  ferric uptake regulator  42.02 
 
 		 148 aa  92  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000701006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0730  ferric uptake regulator  42.02 
 
 		 148 aa  92  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177584  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0567  ferric uptake regulator  42.02 
 
 		 148 aa  92  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138653  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  42.99 
 
 		 143 aa  91.7  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0833  ferric uptake regulator  41.96 
 
 		 147 aa  91.3  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004126  ferric uptake regulation protein FUR  41.53 
 
 		 149 aa  91.3  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1937  ferric uptake regulator  41.23 
 
 		 143 aa  90.9  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1716  ferric uptake regulator  41.23 
 
 		 143 aa  90.9  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000468341  normal  0.147817 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  42.06 
 
 		 143 aa  90.9  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1641  ferric uptake regulator  41.23 
 
 		 143 aa  90.5  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1716  ferric uptake regulator  41.23 
 
 		 143 aa  90.5  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000280206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1645  ferric uptake regulation protein (ferric uptake regulator)  37.5 
 
 		 155 aa  90.5  8e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2939  ferric uptake regulator, Fur family  40.34 
 
 		 148 aa  90.5  8e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0253838  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1885  ferric uptake regulator family protein  38.84 
 
 		 143 aa  90.1  9e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2050  ferric uptake regulator, Fur family  39.82 
 
 		 141 aa  90.1  9e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0967  ferric uptake regulator, Fur family  39.29 
 
 		 142 aa  89.4  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.924679  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1690  ferric uptake regulator  38.28 
 
 		 150 aa  89.4  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000286155  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2263  ferric uptake regulator  41.23 
 
 		 143 aa  89.4  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1272  ferric uptake regulator family protein  37.27 
 
 		 158 aa  90.1  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  35.9 
 
 		 157 aa  89.4  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  35.9 
 
 		 157 aa  89.4  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1451  ferric uptake regulation protein  38.66 
 
 		 155 aa  89.7  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000060196  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1389  ferric uptake regulation protein  38.66 
 
 		 145 aa  89.7  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000498211  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2622  ferric uptake regulator  41.23 
 
 		 143 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000743772  normal  0.0672977 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>