20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5026 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5026  hypothetical protein  100 
 
 
71 aa  142  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0531958  normal  0.127918 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4375  hypothetical protein  73.91 
 
 
72 aa  100  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3910  hypothetical protein  76.81 
 
 
72 aa  84  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4085  hypothetical protein  80.39 
 
 
77 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.643862  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3894  hypothetical protein  71.83 
 
 
72 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0353972  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4474  hypothetical protein  71.83 
 
 
72 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0944683  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5829  hypothetical protein  71.83 
 
 
72 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000848115  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1386  hypothetical protein  73.24 
 
 
86 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0143082  normal  0.150103 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3539  hypothetical protein  60 
 
 
75 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3552  hypothetical protein  40.74 
 
 
132 aa  55.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0993493  hitchhiker  0.00882594 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0836  hypothetical protein  41.67 
 
 
197 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0056158  normal  0.0202769 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5822  hypothetical protein  43.24 
 
 
99 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207187  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3892  hypothetical protein  30.77 
 
 
349 aa  44.3  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0658  hypothetical protein  48.08 
 
 
103 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.37597  normal  0.653833 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3332  hypothetical protein  44.44 
 
 
200 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000298312 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5019  putative lipoprotein  37.14 
 
 
106 aa  41.6  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0701356  normal  0.0646806 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1572  hypothetical protein  45.16 
 
 
124 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4481  hypothetical protein  48 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3888  hypothetical protein  48 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0588  hypothetical protein  37.33 
 
 
125 aa  40.8  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>