More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4182 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4182  Aldehyde Dehydrogenase  100 
 
 
502 aa  1018    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395716  decreased coverage  0.000171916 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1967  L-sorbosone dehydrogenase, NAD(P) dependent  53.86 
 
 
506 aa  535  1e-151  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.119766  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2045  L-sorbosone dehydrogenase, NAD(P) dependent  53.86 
 
 
506 aa  534  1e-150  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0874  aldehyde dehydrogenase  52.82 
 
 
504 aa  529  1e-149  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1377  Aldehyde Dehydrogenase  50.52 
 
 
506 aa  511  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162758  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1481  Aldehyde Dehydrogenase  50.52 
 
 
506 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.450354  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3171  aldehyde dehydrogenase  49.9 
 
 
502 aa  491  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1856  aldehyde dehydrogenase  51.12 
 
 
505 aa  493  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267986  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3572  betaine-aldehyde dehydrogenase  49.38 
 
 
506 aa  481  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.532115  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3937  betaine-aldehyde dehydrogenase  50.8 
 
 
516 aa  472  1e-132  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.611638 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5240  aldehyde dehydrogenase  50.21 
 
 
504 aa  468  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.979881 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0846  aldehyde dehydrogenase  45.51 
 
 
493 aa  415  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1051  aldehyde dehydrogenase  44.98 
 
 
494 aa  407  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0159067  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4835  Betaine-aldehyde dehydrogenase  44.11 
 
 
505 aa  395  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0460635 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5279  Aldehyde Dehydrogenase  43.95 
 
 
505 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.04 
 
 
496 aa  388  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3226  aldehyde dehydrogenase  43.24 
 
 
493 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  41.84 
 
 
490 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  41.7 
 
 
494 aa  376  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0308  hypothetical protein  41.58 
 
 
488 aa  377  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.68 
 
 
498 aa  376  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  42.68 
 
 
490 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  46.14 
 
 
504 aa  373  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0292  hypothetical protein  41.25 
 
 
488 aa  374  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1036  aldehyde dehydrogenase  41.89 
 
 
494 aa  375  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922959  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5267  aldehyde dehydrogenase  43.34 
 
 
493 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01689  aldehyde dehydrogenase family (Eurofung)  41.37 
 
 
501 aa  371  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.259255 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.62 
 
 
508 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1561  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.51 
 
 
503 aa  369  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.21 
 
 
490 aa  370  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7257  aldehyde dehydrogenase  42.54 
 
 
505 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.548914  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3064  aldehyde dehydrogenase family protein  42.59 
 
 
505 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0192942  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5330  aldehyde dehydrogenase  43.91 
 
 
497 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0557529 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5278  aldehyde dehydrogenase family protein  43.7 
 
 
497 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5188  aldehyde dehydrogenase  43.7 
 
 
526 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.536573  normal  0.0718586 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0192  aldehyde dehydrogenase  43.49 
 
 
497 aa  363  4e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000810218 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  41.41 
 
 
497 aa  362  8e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4844  Aldehyde Dehydrogenase  41.51 
 
 
496 aa  362  8e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.013402 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2222  Aldehyde Dehydrogenase  60.26 
 
 
313 aa  361  1e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.252477 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  41.46 
 
 
483 aa  362  1e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1535  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.62 
 
 
493 aa  361  2e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.378909 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00554  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH)(ALDH)(EC 1.2.1.3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P08157]  40.32 
 
 
497 aa  360  3e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.534945  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  39.96 
 
 
506 aa  360  4e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2605  aldehyde dehydrogenase  40.08 
 
 
494 aa  358  9.999999999999999e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000129908  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6130  Betaine-aldehyde dehydrogenase  39.79 
 
 
492 aa  358  9.999999999999999e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3562  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41 
 
 
494 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37194  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2904  aldehyde dehydrogenase  41.02 
 
 
494 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399829  normal  0.436531 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4781  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.56 
 
 
500 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494412  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3586  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.56 
 
 
500 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5502  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.56 
 
 
500 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0152  Aldehyde Dehydrogenase  41.05 
 
 
510 aa  357  2.9999999999999997e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4109  aldehyde dehydrogenase  41.25 
 
 
496 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0338  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  42.12 
 
 
513 aa  357  2.9999999999999997e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1868  Retinal dehydrogenase  43.96 
 
 
492 aa  356  5e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  38.99 
 
 
483 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18440  Aldehyde dehydrogenase family protein  41.37 
 
 
499 aa  356  5.999999999999999e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.931316  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4941  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.88 
 
 
498 aa  355  6.999999999999999e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1276  aldehyde dehydrogenase  38.45 
 
 
497 aa  356  6.999999999999999e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.420346  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2823  betaine aldehyde dehydrogenase  41.8 
 
 
491 aa  355  7.999999999999999e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0933  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.35 
 
 
500 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  38.79 
 
 
494 aa  354  2e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  38.79 
 
 
494 aa  354  2e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  38.79 
 
 
494 aa  354  2e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  38.79 
 
 
494 aa  354  2e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  39.66 
 
 
473 aa  354  2e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0535  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.32 
 
 
487 aa  354  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  38.79 
 
 
494 aa  354  2e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0092  aldehyde dehydrogenase family protein  43.96 
 
 
497 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.769215  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  39 
 
 
505 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4164  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.93 
 
 
500 aa  353  4e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4432  Aldehyde Dehydrogenase  43.09 
 
 
492 aa  353  5e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0316709  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  38.59 
 
 
494 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2306  aldehyde dehydrogenase  41 
 
 
497 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445313  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  40.99 
 
 
496 aa  353  5.9999999999999994e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2487  aldehyde dehydrogenase family protein  41.37 
 
 
503 aa  352  8e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  38.1 
 
 
490 aa  352  8.999999999999999e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3463  aldehyde dehydrogenase  40.8 
 
 
497 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.506857  normal  0.23094 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  38.59 
 
 
494 aa  352  1e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  38.59 
 
 
494 aa  352  1e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  38.38 
 
 
494 aa  351  2e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  38.7 
 
 
490 aa  351  2e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0965  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  37.66 
 
 
507 aa  350  2e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  38.18 
 
 
494 aa  350  3e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6831  aldehyde dehydrogenase  40.25 
 
 
493 aa  350  3e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1527  transposase, IS605 OrfB family  45.01 
 
 
421 aa  350  4e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2053  aldehyde dehydrogenase family protein  41.92 
 
 
499 aa  349  5e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05070  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH), putative  38.8 
 
 
524 aa  349  6e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0958  aldehyde dehydrogenase  39.46 
 
 
492 aa  349  8e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.938749  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0049  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.92 
 
 
505 aa  348  9e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2474  aldehyde dehydrogenase  40.6 
 
 
497 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109881  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6087  putative aldehyde dehydrogenase  41.39 
 
 
497 aa  348  1e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0227  aldehyde dehydrogenase  42.92 
 
 
499 aa  348  1e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4688  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.09 
 
 
500 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3955  aldehyde dehydrogenase  41.52 
 
 
495 aa  348  1e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768123  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70140  putative aldehyde dehydrogenase  41.39 
 
 
497 aa  348  1e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643605  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  41.67 
 
 
496 aa  348  1e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0050  phenylacetaldehyde dehydrogenase  42.86 
 
 
501 aa  348  2e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6789  Aldehyde Dehydrogenase  42.47 
 
 
495 aa  347  2e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.772669  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29563  Aldehyde dehydrogenase  39.8 
 
 
495 aa  348  2e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.161421  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2946  aldehyde dehydrogenase  40.6 
 
 
497 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.264552 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>