24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3874 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3874  AAA ATPase  100 
 
 
351 aa  719    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2896  hypothetical protein  44.44 
 
 
356 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0211  hypothetical protein  44.44 
 
 
356 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3503  AAA ATPase  33.13 
 
 
345 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4576  AAA ATPase  33.13 
 
 
345 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4741  AAA ATPase  33.33 
 
 
335 aa  146  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4716  AAA ATPase  31.41 
 
 
344 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0132435  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3185  AAA ATPase  29.1 
 
 
338 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.820352  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1982  AAA ATPase  29.39 
 
 
382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.135129 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2452  AAA ATPase  31.18 
 
 
371 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  hitchhiker  0.000127751 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1658  ATP-binding protein  26.48 
 
 
371 aa  93.2  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0543  hypothetical protein  27.76 
 
 
319 aa  89.4  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0066  ATPase  27.09 
 
 
492 aa  73.2  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4945  ATPase  27.09 
 
 
492 aa  73.2  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.206072 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1714  ATPase  27.09 
 
 
492 aa  73.2  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1331  ATPase  27.09 
 
 
492 aa  73.2  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0192  ATPase  27.09 
 
 
492 aa  73.2  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.866299  normal  0.0299371 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1037  AAA ATPase  24.91 
 
 
388 aa  68.9  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3569  AAA ATPase  23.97 
 
 
338 aa  63.9  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.628974 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4431  hypothetical protein  21.88 
 
 
396 aa  63.2  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0466568  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0007  AAA ATPase  29.26 
 
 
319 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0009  AAA ATPase  29.26 
 
 
319 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0992238  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0007  AAA ATPase  29.26 
 
 
319 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00746213  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0015  AAA ATPase  29.26 
 
 
319 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>