20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3697 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3697  hypothetical protein  100 
 
 
200 aa  394  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.768044  hitchhiker  0.0000159971 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6972  hypothetical protein  46.74 
 
 
200 aa  164  9e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000000112852  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3676  hypothetical protein  44.97 
 
 
200 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356911 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2165  hypothetical protein  44.72 
 
 
194 aa  129  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.700991  normal  0.412034 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5924  hypothetical protein  43.48 
 
 
190 aa  120  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1086  hypothetical protein  39.55 
 
 
200 aa  109  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.59439 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0260  hypothetical protein  54.9 
 
 
110 aa  93.6  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0108254 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1628  hypothetical protein  28.8 
 
 
199 aa  74.3  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5013  hypothetical protein  28.26 
 
 
195 aa  62  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.228518 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2150  hypothetical protein  32.64 
 
 
195 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1338  hypothetical protein  29.83 
 
 
193 aa  55.8  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0482  hypothetical protein  28.66 
 
 
197 aa  54.3  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5848  hypothetical protein  30.71 
 
 
194 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629993  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1705  hypothetical protein  29.79 
 
 
195 aa  52.4  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00494944  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0957  hypothetical protein  23.61 
 
 
202 aa  50.1  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.113954  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0611  hypothetical protein  27.85 
 
 
165 aa  50.1  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.895734 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0395  hypothetical protein  30.3 
 
 
205 aa  49.7  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.21361  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3611  hypothetical protein  30.46 
 
 
193 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.247774  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3108  hypothetical protein  30.9 
 
 
193 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0773  hypothetical protein  24.38 
 
 
387 aa  41.2  0.01  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.483211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>